RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00862	A6NCI5	91 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPA-222	ENST00000445241	CRYGD	P07320	174 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPA-222	ENST00000445241	CEBPG	P53567	150 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPA-222	ENST00000445241	CT83	Q5H943	113 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPA-222	ENST00000445241		Q6ZR54	194 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPA-222	ENST00000445241	LINC01551	Q86U37	167 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPA-222	ENST00000445241	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPA-222	ENST00000445241	RYR3	Q15413	4870 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPA-222	ENST00000445241	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPA-222	ENST00000445241	AP1S3	Q96PC3	154 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPA-222	ENST00000445241	CNFN	Q9BYD5	112 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPA-222	ENST00000445241	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPA-222	ENST00000445241		Q9H8V8	135 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPA-222	ENST00000445241	JPT2	Q9H910	190 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPA-222	ENST00000445241	RYR2	Q92736	4967 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPA-222	ENST00000445241	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241		A8MWL6	223 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	CTRL	P40313	264 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	TTC32	Q5I0X7	151 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241		K7EP13	123 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	RAB4B	P61018	213 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	OSTC	Q9NRP0	149 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241		A0A087WWL8	130 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	FAM231B	A6NCW3	169 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	TRGC1	P0CF51	173 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00694	P0DN24	101 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	GZMB	P10144	247 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	ERVFC1-1	P60608	527 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241		Q6ZSN1	163 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	NAT8	Q9UHE5	227 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241		C9JQL5	133 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	SIVA1	O15304	175 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	SMIM17	P0DL12	118 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	TPPP3	Q9BW30	176 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	ISOC2	Q96AB3	205 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	NTF3	P20783	257 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241	TSKU	Q8WUA8	353 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PTPA-222	ENST00000445241		A0A087WWC5	75 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241		H7C1H1	209 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241		M0R2N4	97 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF56	Q15929	161 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241	LELP1	Q5T871	98 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241	GTSF1	Q8WW33	167 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00315	P59091	139 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241	GAGE12J	A6NER3	117 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241		F5H697	171 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241	GAGE1	Q13065	139 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241	GAGE4	Q13068	117 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241	GAGE5	Q13069	117 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241	ADIRF	Q15847	76 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241	GAGE13	Q4V321	117 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241	UQCC3	Q6UW78	93 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241	BORCS7	Q96B45	105 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241		V9GYV3	84 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241	EVI2A	P22794	236 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241	UBE2D3	P61077	147 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241	UBE2D2	P62837	147 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241	TWIST1	Q15672	202 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPA-222	ENST00000445241	C6orf223	Q8N319	242 aa		9.99	□□□□□ -0.81

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