RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 OR51M1Q9H341 326 aa4.42□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.42□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1W2PRE2 83 aa4.41□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 C1orf196B1AJZ1 125 aa4.41□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 RAB5AP20339 215 aa4.41□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 S100PP25815 95 aa4.41□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 AKR1C3P42330 323 aa4.41□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 CRYBA4P53673 196 aa4.41□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 TCL1AP56279 114 aa4.41□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa4.41□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 WFDC10BQ8IUB3 73 aa4.41□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa4.41□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 FRZBQ92765 325 aa4.41□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 BIN3Q9NQY0 253 aa4.41□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 ICOSQ9Y6W8 199 aa4.41□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 TRBV19A0A075B6N1 114 aa4.4□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 PPP1R2P9O14990 202 aa4.4□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 OR10J4P0C629 311 aa4.4□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 RAB5BP61020 215 aa4.4□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa4.4□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 TCEAL7Q9BRU2 100 aa4.4□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 SLC25A2Q9BXI2 301 aa4.4□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF253O75346 499 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 NBEAP1P0C6P0 100 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 PYYP10082 97 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 CRISP2P16562 243 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 GCSHP23434 173 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 RPL23P62829 140 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 ELOBQ15370 118 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 ISOC2Q96AB3 205 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 BTF3L4Q96K17 158 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 VGLL1Q99990 258 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 MSRB1Q9NZV6 116 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 PRO0255Q9UI72 69 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 LRCOL1A6NCL2 159 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 C5orf52A6NGY3 159 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 C9JCJ5 164 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 K7EQD1 137 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 S100A9P06702 114 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 GNG4P50150 75 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 RPL19P84098 196 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 KCNIP4Q6PIL6 250 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 NEGR1Q7Z3B1 354 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 NFE4Q86UQ8 179 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 C11orf52Q96A22 123 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF479Q96JC4 524 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 LINC00477Q96M19 166 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM14CQ9P0S9 112 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 HHLA3Q9XRX5 114 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 LY96Q9Y6Y9 160 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa4.38□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa4.38□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 PGPA6NDG6 321 aa4.38□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 K7EQM0 130 aa4.38□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 GPX1P07203 203 aa4.38□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 PFN1P07737 140 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 RPL35P42766 123 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 RANP62826 216 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 LINC01551Q86U37 167 aa4.38□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 CMTM2Q8TAZ6 248 aa4.38□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 BLNKQ8WV28 456 aa4.38□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 FXYD5Q96DB9 178 aa4.38□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 IMMP2LQ96T52 175 aa4.38□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa4.38□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 DIRC3C9JPN6 131 aa4.37□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 S100A6P06703 90 aa4.37□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 RPS10P46783 165 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 UBE2G1P62253 170 aa4.37□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 MUC21Q5SSG8 566 aa4.37□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 LINC00518Q8N0U6 118 aa4.37□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 C5orf17Q8NAS9 161 aa4.37□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 OR10G8Q8NGN5 311 aa4.37□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 OCC1Q8TAD7 63 aa4.37□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 Q8TAT8 98 aa4.37□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 SFRP2Q96HF1 295 aa4.37□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 DERL1Q9BUN8 251 aa4.37□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 AAMDCQ9H7C9 122 aa4.37□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 OTORQ9NRC9 128 aa4.37□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF492Q9P255 531 aa4.37□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 EPDR1Q9UM22 224 aa4.37□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa4.36□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa4.36□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa4.36□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 GGTLC3B5MD39 225 aa4.36□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 PEX7O00628 323 aa4.36□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.1 ms