RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428450.5

DDX39B-209, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 4

Gene DDX39B, Length 633 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-209ENST00000428450 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 COLCA2A8K830 154 aa7.2□□□□□ -1.26
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DDX39B-209ENST00000428450 CHTF8P0CG12 524 aa7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.2□□□□□ -1.26
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DDX39B-209ENST00000428450 LINC00479Q96M42 142 aa7.2□□□□□ -1.26
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DDX39B-209ENST00000428450 SDF2L1Q9HCN8 221 aa7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.19□□□□□ -1.26
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DDX39B-209ENST00000428450 ADCYAP1P18509 176 aa7.19□□□□□ -1.26
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DDX39B-209ENST00000428450 ZNF506Q5JVG8 444 aa7.19□□□□□ -1.26
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DDX39B-209ENST00000428450 LYPD6BQ8NI32 183 aa7.19□□□□□ -1.26
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DDX39B-209ENST00000428450 C7orf33Q8WU49 177 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 TMED6Q8WW62 240 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 PTH2Q96A98 100 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 FXYD5Q96DB9 178 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 DPH3Q96FX2 82 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 C9orf85Q96MD7 179 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 NMES1Q9C002 83 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 UQCC1Q9NVA1 299 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 TAAR5O14804 337 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 SCGB1D2O95969 90 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 HLA-DQA1P01909 254 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 MT-ND4LP03901 98 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 CSN1S1P47710 185 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 AKR1D1P51857 326 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 PEA15Q15121 130 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 TVP23CQ96ET8 276 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 KCNS1Q96KK3 526 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 PARLQ9H300 379 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 C9orf170A2RU37 121 aa7.17□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 C1orf196B1AJZ1 125 aa7.17□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 LINC00587B1AMM8 73 aa7.17□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 BLOC1S1P78537 153 aa7.17□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.17□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 UFSP1Q6NVU6 142 aa7.17□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.17□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 MIR17HGQ75NE6 70 aa7.17□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 SMDT1Q9H4I9 107 aa7.17□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 CYTL1Q9NRR1 136 aa7.17□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.17□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 PGPA6NDG6 321 aa7.16□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 F6UZH7 168 aa7.16□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 CST7O76096 145 aa7.16□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 MBPP02686 304 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 RANP62826 216 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa7.16□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 AQP10Q96PS8 301 aa7.16□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 SLPIP03973 132 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 BAXQ07812 192 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 IL15RAQ13261 267 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 KCNIP4Q6PIL6 250 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 GTSF1Q8WW33 167 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX39B-209ENST00000428450 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-209ENST00000428450 CRPP02741 224 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-209ENST00000428450 SULT1A2P50226 295 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-209ENST00000428450 FAM74A1Q5RGS3 127 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-209ENST00000428450 OR10G7Q8NGN6 311 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-209ENST00000428450 HIST1H2BAQ96A08 127 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-209ENST00000428450 JPT2Q9H910 190 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-209ENST00000428450 GSKIPQ9P0R6 139 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-209ENST00000428450 FAM24AA6NFZ4 105 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-209ENST00000428450 A8MWV9 139 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-209ENST00000428450 MIAQ16674 131 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-209ENST00000428450 MPV17L2Q567V2 206 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-209ENST00000428450 CBLN2Q8IUK8 224 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-209ENST00000428450 C11orf1Q9H5F2 150 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-209ENST00000428450 TREM1Q9NP99 234 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-209ENST00000428450 VAX2Q9UIW0 290 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-209ENST00000428450 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-209ENST00000428450 TMEM262E9PQX1 116 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-209ENST00000428450 ANGP03950 147 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-209ENST00000428450 PET100P0DJ07 73 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-209ENST00000428450 FGF7P21781 194 aa7.12□□□□□ -1.27
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