RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 CXCL1P09341 107 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 HAMPP81172 84 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 UFSP1Q6NVU6 142 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 OR4C5Q8NGB2 326 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 B4DEV8 164 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 IGLV2-8P01709 118 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 BCL2P10415 239 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 ASIPP42127 132 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 RPL35P42766 123 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 NHLRC2Q8NBF2 726 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 SMIM12Q96EX1 92 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 DERL1Q9BUN8 251 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 J3QL48 77 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 PDE6DO43924 150 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 TIRAPP58753 221 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 ZFP2Q6ZN57 461 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 BAGE2Q86Y30 109 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 FAT1Q14517 4588 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 A8MWV9 139 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 M0R036 132 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 ARMS2P0C7Q2 107 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 ALKAL2Q6UX46 152 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 PARLQ9H300 379 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 VAX2Q9UIW0 290 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 H3BVH4 76 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 SNAI2O43623 268 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 IFNA1P01562 189 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 LINC00694P0DN24 101 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 S100A4P26447 101 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 Q8N814 137 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 Q9HAA7 133 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 GRIFINA4D1Z8 144 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 C19orf71A6NCJ1 209 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 MGST1P10620 155 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 BLOC1S1P78537 153 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 RHOHQ15669 191 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 CENPWQ5EE01 88 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 SFRP2Q96HF1 295 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 OR5AL1P0C617 328 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 RPL19P84098 196 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 JPT2Q9H910 190 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 RAB19A4D1S5 217 aa8.24□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 SYT8Q8NBV8 401 aa8.24□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.24□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 TMEM250H0YL14 139 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 RHODO00212 210 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 IGHV3-30P01768 117 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 IGHV3-33P01772 117 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 IGLC6P0CF74 106 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 GNG4P50150 75 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 LAGE3Q14657 143 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 ZFP82Q8N141 532 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 TM2D2Q9BX73 214 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 MED9Q9NWA0 146 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 RBFOX3A6NFN3 312 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 LELP1Q5T871 98 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 PRR27Q6MZM9 219 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 OR10AG1Q8NH19 301 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-204ENST00000403441 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 Q9UF83 564 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 K7EN84 100 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 M0R381 172 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 FAM210AQ96ND0 272 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 BIN3Q9NQY0 253 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 Q6ZSA8 131 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 OCC1Q8TAD7 63 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 CNFNQ9BYD5 112 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 A0A087WWL8 130 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa8.18□□□□□ -1.1
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