RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 M0R2Z0 102 aa4.41□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 GNRH2O43555 120 aa4.41□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 LINC00614P0C842 121 aa4.41□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 RBMY1CP0DJD4 496 aa4.41□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 PMCHP20382 165 aa4.41□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 LINC00315P59091 139 aa4.41□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 SPINK13Q1W4C9 94 aa4.41□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 MUC21Q5SSG8 566 aa4.41□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 FAM159AQ6UWV7 190 aa4.41□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 PTH2Q96A98 100 aa4.41□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 PRELID3AQ96N28 172 aa4.41□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 CITED1Q99966 193 aa4.41□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 C20orf144Q9BQM9 153 aa4.41□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa4.41□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa4.41□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 NF1P21359 2839 aa4.41□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 C2CD3Q4AC94 2353 aa4.41□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa4.4□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 EVI2AP22794 236 aa4.4□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa4.4□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4.4□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 NRACQ8N912 160 aa4.4□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 Q8N976 141 aa4.4□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 MRAP2Q96G30 205 aa4.4□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 NAGKQ9UJ70 344 aa4.4□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa4.39□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 TRGV11A0A075B6L2 103 aa4.39□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 OR11H12B2RN74 326 aa4.39□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 M0R381 172 aa4.39□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 SAP30O75446 220 aa4.39□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 HSBP1O75506 76 aa4.39□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 GAS8-AS1O95177 125 aa4.39□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 NPYP01303 97 aa4.39□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 IGKV3-20P01619 116 aa4.39□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 S100A4P26447 101 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 CKS2P33552 79 aa4.39□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 AMTP48728 403 aa4.39□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 INSL3P51460 131 aa4.39□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 S100A12P80511 92 aa4.39□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 SPANXN1Q5VSR9 72 aa4.39□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 SMIM15Q7Z3B0 74 aa4.39□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 SAMD10Q9BYL1 202 aa4.39□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 DPH3P1Q9H4G8 78 aa4.39□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 NIT2Q9NQR4 276 aa4.39□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 MDFICQ9P1T7 246 aa4.39□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa4.39□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 A0A096LNJ9 63 aa4.38□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa4.38□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 SMKR1H3BMG3 65 aa4.38□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 CD7P09564 240 aa4.38□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 RPL32P62910 135 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 FAM19A2Q8N3H0 131 aa4.38□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 WFDC9Q8NEX5 89 aa4.38□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 AP1S3Q96PC3 154 aa4.38□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 VCX2Q9H322 139 aa4.38□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 MAP1LC3AQ9H492 121 aa4.38□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 ZMAT4Q9H898 229 aa4.38□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 EDA2RQ9HAV5 297 aa4.38□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 SORL1Q92673 2214 aa4.38□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 F8P00451 2351 aa4.38□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa4.37□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 SPRY2O43597 315 aa4.37□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 NCR2O95944 276 aa4.37□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 INSP01308 110 aa4.37□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 CRYGDP07320 174 aa4.37□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 C3orf79P0CE67 100 aa4.37□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 TEX43Q6ZNM6 134 aa4.37□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 FA2HQ7L5A8 372 aa4.37□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 SPATA12Q7Z6I5 190 aa4.37□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 C1orf158Q8N1D5 194 aa4.37□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 Q8N8P6 123 aa4.37□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 C11orf72Q8NBR9 251 aa4.37□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa4.37□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 IL17DQ8TAD2 202 aa4.37□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 RASL10AQ92737 203 aa4.37□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 C20orf78Q9BR46 151 aa4.37□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 NDUFAF3Q9BU61 184 aa4.37□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 AGRNO00468 2067 aa4.37□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 MUC4Q99102 2169 aa4.37□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa4.36□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 K7EMI3 77 aa4.36□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 PPP1R17O96001 155 aa4.36□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 FXYD7P58549 80 aa4.36□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa4.36□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 C9orf66Q5T8R8 295 aa4.36□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 UFSP1Q6NVU6 142 aa4.36□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
C6orf48-208ENST00000395788 STHQ8IWL8 128 aa4.36□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.2 ms