RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639850.1

ME2-216, Transcript of malic enzyme 2, human

TSL 5 BASIC

Gene ME2, Length 2,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ME2-216	ENST00000639850	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		15.29	■□□□□ 0.04
ME2-216	ENST00000639850	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	15.29	■□□□□ 0.04
ME2-216	ENST00000639850	HBD	P02042	147 aa		15.29	■□□□□ 0.04
ME2-216	ENST00000639850	CUBN	O60494	3623 aa		15.29	■□□□□ 0.04
ME2-216	ENST00000639850	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	15.29	■□□□□ 0.04
ME2-216	ENST00000639850	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		15.28	■□□□□ 0.04
ME2-216	ENST00000639850	TSPO	P30536	169 aa		15.28	■□□□□ 0.04
ME2-216	ENST00000639850	CDKN1B	P46527	198 aa		15.28	■□□□□ 0.04
ME2-216	ENST00000639850	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		15.28	■□□□□ 0.04
ME2-216	ENST00000639850	MUC4	Q99102	2169 aa		15.28	■□□□□ 0.04
ME2-216	ENST00000639850	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	15.27	■□□□□ 0.04
ME2-216	ENST00000639850	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		15.27	■□□□□ 0.04
ME2-216	ENST00000639850	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		15.27	■□□□□ 0.04
ME2-216	ENST00000639850	CD7	P09564	240 aa		15.27	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		15.27	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	NRAC	Q8N912	160 aa		15.27	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	MRAP2	Q96G30	205 aa		15.27	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		15.27	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	MTOR	P42345	2549 aa		15.26	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	LINC01546	A6NGU7	62 aa		15.26	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	15.26	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850		A0A1W2PRX2	142 aa		15.26	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	CD28	P10747	220 aa		15.26	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	RAX2	Q96IS3	184 aa		15.26	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		15.25	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	IGLC3	P0DOY3	106 aa		15.25	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	DEFB131A	P59861	70 aa		15.25	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850		Q8N8P6	123 aa		15.25	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	LINC01545	Q5VT33	79 aa		15.25	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	AP1S3	Q96PC3	154 aa		15.25	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		15.25	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	IGLL1	P15814	213 aa		15.24	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	LINC01006	Q8NI28	216 aa		15.24	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	PRSS47	A8MTI9	375 aa		15.23	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	AMTN	Q6UX39	209 aa		15.23	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	C16orf95	Q9H693	158 aa		15.23	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		15.23	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	KNCN	A6PVL3	124 aa		15.23	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	NXPH4	O95158	308 aa		15.23	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		15.23	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		15.23	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		15.22	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	DEFB125	Q8N687	156 aa		15.22	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		15.22	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	MGP	P08493	103 aa		15.22	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	FCER1G	P30273	86 aa		15.22	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	SMR3A	Q99954	134 aa		15.22	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	CCL24	O00175	119 aa		15.21	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	TMEM160	Q9NX00	188 aa		15.21	■□□□□ 0.03
ME2-216	ENST00000639850	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		15.21	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850		M0R143	59 aa		15.21	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	EREG	O14944	169 aa		15.21	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	HLA-DRB4	P13762	266 aa		15.21	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	FHL3	Q13643	280 aa		15.21	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		15.21	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		15.21	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		15.21	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		15.2	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	hDV102S1	A0JD36	115 aa		15.2	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		15.2	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	HILS1	P60008	231 aa		15.2	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850		Q8N1Y9	231 aa		15.2	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	SMIM17	P0DL12	118 aa		15.19	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850		Q6ZN92	141 aa		15.19	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	RASL10A	Q92737	203 aa		15.19	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850		H3BMM0	161 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	ZNF124	Q15973	351 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	C9orf85	Q96MD7	179 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	LAGE3	Q14657	143 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	C18orf15	Q96N68	181 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	ST20	Q9HBF5	79 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	HIVEP2	P31629	2446 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850		A8MTW9	85 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	TCAP	O15273	167 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	C20orf78	Q9BR46	151 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	JPT2	Q9H910	190 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ME2-216	ENST00000639850	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02

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