RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617719.4

ATXN3-251, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ATXN3, Length 1,074 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-251ENST00000617719 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 TIMM23O14925 209 aa3.49□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 TNFSF12O43508 249 aa3.49□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 CRYGAP11844 174 aa3.49□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 PSMB8P28062 276 aa3.49□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 TAS2R45P59539 299 aa3.49□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 RPL23P62829 140 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 CCL20P78556 96 aa3.49□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 PMAIP1Q13794 54 aa3.49□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 KISS1Q15726 138 aa3.49□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 C17orf58Q2M2W7 97 aa3.49□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 Q499Y3 187 aa3.49□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa3.49□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 SH2D6Q7Z4S9 175 aa3.49□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa3.49□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 LRTM2Q8N967 370 aa3.49□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 ZNF114Q8NC26 417 aa3.49□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 ZNF714Q96N38 554 aa3.49□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa3.49□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 GNB1LQ9BYB4 327 aa3.49□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 IMUPQ9GZP8 106 aa3.49□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 TNFRSF19Q9NS68 423 aa3.49□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa3.49□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 KLF12Q9Y4X4 402 aa3.49□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa3.48□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 OOSP1A8MZH6 123 aa3.48□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 H3BSH0 61 aa3.48□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 J3QQQ9 107 aa3.48□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 OXTP01178 125 aa3.48□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 BCL2P10415 239 aa3.48□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 PFN2P35080 140 aa3.48□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 EDDM3BP56851 147 aa3.48□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 Q56UQ5 140 aa3.48□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 LYRM7Q5U5X0 104 aa3.48□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 C2orf91Q6ZV80 131 aa3.48□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 NUP35Q8NFH5 326 aa3.48□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 OR10G8Q8NGN5 311 aa3.48□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 PGLYRP3Q96LB9 341 aa3.48□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 LINC00479Q96M42 142 aa3.48□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 SPACA5Q96QH8 159 aa3.48□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 TMEM59Q9BXS4 323 aa3.48□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 ZNF702PQ9H963 129 aa3.48□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 DPM3Q9P2X0 92 aa3.48□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 OR2W1Q9Y3N9 320 aa3.48□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa3.48□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa3.47□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa3.47□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 GRIFINA4D1Z8 144 aa3.47□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 PRSS46E5RG02 174 aa3.47□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa3.47□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 FCN1O00602 326 aa3.47□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 PIN1P1O15428 100 aa3.47□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 DEDDO75618 318 aa3.47□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 NDUFB4O95168 129 aa3.47□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 TRACP01848 142 aa3.47□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 CD3DP04234 171 aa3.47□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 CBLN1P23435 193 aa3.47□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 COX7A1P24310 79 aa3.47□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 INSL3P51460 131 aa3.47□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 BLCAPP62952 87 aa3.47□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 UNC119Q13432 240 aa3.47□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 EBI3Q14213 229 aa3.47□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 INSL4Q14641 139 aa3.47□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 HAPLN4Q86UW8 402 aa3.47□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 TEN1Q86WV5 123 aa3.47□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 TEX45Q8NA69 505 aa3.47□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 WFDC9Q8NEX5 89 aa3.47□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa3.47□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 SMIM7Q9BQ49 75 aa3.47□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 V9GY05 133 aa3.47□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa3.47□□□□□ -1.85
ATXN3-251ENST00000617719 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa3.46□□□□□ -1.86
ATXN3-251ENST00000617719 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa3.46□□□□□ -1.86
ATXN3-251ENST00000617719 A0A1B0GUV1 79 aa3.46□□□□□ -1.86
ATXN3-251ENST00000617719 C2orf70A6NJV1 201 aa3.46□□□□□ -1.86
ATXN3-251ENST00000617719 H3BTX0 84 aa3.46□□□□□ -1.86
ATXN3-251ENST00000617719 H7C1H1 209 aa3.46□□□□□ -1.86
ATXN3-251ENST00000617719 SPINT2O43291 252 aa3.46□□□□□ -1.86
ATXN3-251ENST00000617719 IGF1P05019 195 aa3.46□□□□□ -1.86
ATXN3-251ENST00000617719 OR5AL1P0C617 328 aa3.46□□□□□ -1.86
ATXN3-251ENST00000617719 P0DMU3 169 aa3.46□□□□□ -1.86
ATXN3-251ENST00000617719 FAM231AP0DMU4 169 aa3.46□□□□□ -1.86
ATXN3-251ENST00000617719 FAM231CP0DMU5 169 aa3.46□□□□□ -1.86
ATXN3-251ENST00000617719 HLA-DMBP28068 263 aa3.46□□□□□ -1.86
ATXN3-251ENST00000617719 LY6EQ16553 131 aa3.46□□□□□ -1.86
ATXN3-251ENST00000617719 FAM27D1Q5T7N8 215 aa3.46□□□□□ -1.86
ATXN3-251ENST00000617719 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa3.46□□□□□ -1.86
ATXN3-251ENST00000617719 Q6ZS49 121 aa3.46□□□□□ -1.86
ATXN3-251ENST00000617719 LINC00596Q86U02 117 aa3.46□□□□□ -1.86
ATXN3-251ENST00000617719 HOGA1Q86XE5 327 aa3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.9 ms