RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 COQ2Q96H96 371 aa8.61□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa8.61□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 PRO0461Q9UI25 63 aa8.61□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 HERV-K104P63124 156 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 GAGE13Q4V321 117 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 Q6ZR54 194 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 OR10X1Q8NGY0 326 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 HARBI1Q96MB7 349 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 CDIP1Q9H305 208 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 M0R2N4 97 aa8.59□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 SPRY2O43597 315 aa8.59□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 NDPQ00604 133 aa8.59□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 FOXI1Q12951 378 aa8.59□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 ZNF562Q6V9R5 426 aa8.59□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 ZNF497Q6ZNH5 498 aa8.59□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 LINC00173Q6ZV60 143 aa8.59□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 STPG3Q8N7X2 389 aa8.59□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.59□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 TRAV24A0A0B4J272 114 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 IGLL5B9A064 214 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 M0QXV9 152 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 MOSP00540 346 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 DUTP33316 252 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 G6PCP35575 357 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 WFDC2Q14508 124 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 PSG5Q15238 335 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 DEFB135Q30KP9 77 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 Q6ZUT4 128 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 Q8IYB0 196 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 CACNG8Q8WXS5 425 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 LEAP2Q969E1 77 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 SPANXCQ9NY87 97 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 A0A1B0GWB2 263 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 HIGD1CA8MV81 97 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 C8orf88P0DMB2 117 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 KIR2DS2P43631 304 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 SYNJ2BPP57105 145 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 ZNF146Q15072 292 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 MOB3BQ86TA1 216 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 IL1F10Q8WWZ1 152 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 RITA1Q96K30 269 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 KLF12Q9Y4X4 402 aa8.57□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 GGTLC3B5MD39 225 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 CGB3P0DN86 165 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 CGB7P0DN87 165 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 DEFA4P12838 97 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 RPL30P62888 115 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 RAB37Q96AX2 223 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 SLC25A2Q9BXI2 301 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 TMEM126AQ9H061 195 aa8.56□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 GAGE12JA6NER3 117 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 PEX7O00628 323 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 CHEK1O14757 476 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 GAGE7O76087 117 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 APOMO95445 188 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 GAGE12FP0CL80 117 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 GAGE12GP0CL81 117 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 GAGE12IP0CL82 117 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 GAGE4Q13068 117 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 ETDBQ3ZM63 59 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 CEND1Q8N111 149 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 LINC00574Q9H8X3 128 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa8.55□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 C19orf71A6NCJ1 209 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 RHODO00212 210 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 ASIPP42127 132 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 ECSCRQ19T08 205 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 RRN3P1Q2M238 152 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 Q6AWC8 147 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 TRAT1Q6PIZ9 186 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 MIR17HGQ75NE6 70 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 SYT8Q8NBV8 401 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 ZNF503Q96F45 646 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa8.54□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
HCG18-241ENST00000602290 UFC1Q9Y3C8 167 aa8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.9 ms