RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 LTAP01374 205 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 P01737 135 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 IGLC2P0DOY2 106 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 RPL7P18124 248 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 CSN1S1P47710 185 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 TCL1AP56279 114 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 TPPP2P59282 170 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 RAB4BP61018 213 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC35B1P78383 322 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 PSG9Q00887 426 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 IQCJQ1A5X6 159 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 KLK9Q2XQG4 91 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 OR10J3Q5JRS4 329 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM136Q6ZRR5 245 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 C10orf105Q8TEF2 133 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 TSKUQ8WUA8 353 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 RASL10AQ92737 203 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 KIR2DL4Q99706 377 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 VGLL1Q99990 258 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 HSPB9Q9BQS6 159 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 GFRA4Q9GZZ7 299 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF702PQ9H963 129 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 RABAC1Q9UI14 185 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 KLK9Q9UKQ9 250 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 KLF12Q9Y4X4 402 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 S4R3C0 116 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 ATMQ13315 3056 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa3.03□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa3.03□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 GRIFINA4D1Z8 144 aa3.03□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 C19orf71A6NCJ1 209 aa3.03□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 OR2T8A6NH00 312 aa3.03□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM223BA6NKX1 122 aa3.03□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 HIGD1CA8MV81 97 aa3.03□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 SPINK4O60575 86 aa3.03□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV1-69P01742 117 aa3.03□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV3-23P01764 117 aa3.03□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 APCSP02743 223 aa3.03□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 ESDP10768 282 aa3.03□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 PAFAH1B2P68402 229 aa3.03□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 HBBP68871 147 aa3.03□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 Q0VG73 95 aa3.03□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 PSG3Q16557 428 aa3.03□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 C15orf32Q32M92 178 aa3.03□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 PRNTQ86SH4 94 aa3.03□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 BAGE3Q86Y29 109 aa3.03□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM223AQ8IWN6 122 aa3.03□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa3.03□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 C5orf56Q8N8D9 126 aa3.03□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 NUP35Q8NFH5 326 aa3.03□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 BORCS7Q96B45 105 aa3.03□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF414Q96IQ9 312 aa3.03□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNS1Q96KK3 526 aa3.03□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa3.03□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 ZFP30Q9Y2G7 519 aa3.03□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 MTORP42345 2549 aa3.03□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 ABCA2Q9BZC7 2435 aa3.03□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 NF1P21359 2839 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 TRAV41A0A0B4J266 112 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A0J9YWU9 116 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1B0GXF2 115 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 H3BUA1 57 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 K7EMT4 169 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 M0QZK8 103 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 SERF1AO75920 110 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 MSMBP08118 114 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 CTSGP08311 255 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 GZMBP10144 247 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 COX6B1P14854 86 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC25A16P16260 332 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 SRIP30626 198 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 PKIAP61925 76 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
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CAPNS1-210ENST00000590211 ATP5G2Q06055 141 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM162BQ5T6X4 162 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 Q6AWC8 147 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 TCF24Q7RTU0 167 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM256Q8N2U0 113 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 OR2D3Q8NGH3 330 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 METTL26Q96S19 204 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC50A1Q9BRV3 221 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 NDFIP1Q9BT67 221 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 SAMD10Q9BYL1 202 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 PSG8Q9UQ74 426 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1B0GW15 77 aa3.01□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 LINC00587B1AMM8 73 aa3.01□□□□□ -1.93
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