RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 GUK1Q16774 197 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 MUC21Q5SSG8 566 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD164L2Q6UWJ8 174 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 IQCF2Q8IXL9 164 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 C15orf53Q8NAA6 179 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 C11orf52Q96A22 123 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 FXYD5Q96DB9 178 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 PAXXQ9BUH6 204 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC25A31Q9H0C2 315 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 Q9H3A6 140 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNF24Q9Y225 148 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 FUT9Q9Y231 359 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSPB11Q9Y547 144 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A096LPF7 62 aa3.05□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa3.05□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 C17orf112F2Z3M2 114 aa3.05□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPX1P07203 203 aa3.05□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARL14EPLP0DKL9 152 aa3.05□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 M6PRP20645 277 aa3.05□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPL12P30050 165 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 RANP62826 216 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDE6HQ13956 83 aa3.05□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 KHDC3LQ587J8 217 aa3.05□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM78Q5T7P6 136 aa3.05□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 SSX7Q7RTT5 188 aa3.05□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa3.05□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 ODF3Q96PU9 254 aa3.05□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 MARVELD1Q9BSK0 173 aa3.05□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR51M1Q9H341 326 aa3.05□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 WFDC1Q9HC57 220 aa3.05□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM14CQ9P0S9 112 aa3.05□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC00588Q9Y4M8 146 aa3.05□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLF12Q9Y4X4 402 aa3.05□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRP1BQ9NZR2 4599 aa3.05□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 APOBP04114 4563 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1B0GVY2 172 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLLNB2CW77 178 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF253O75346 499 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 IFNA5P01569 189 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 NBEAP1P0C6P0 100 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 SFTA3P0C7M3 94 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 CSN1S1P47710 185 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCL18P55774 89 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 RIGQ13278 110 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP6V1FQ16864 119 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM183BQ1AE95 376 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1orf134Q5TEV5 83 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 Q6ZR54 194 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC00299Q6ZSB3 139 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC00336Q6ZUF6 198 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM183AQ8IXX5 376 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 C11orf72Q8NBR9 251 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF680Q8NEM1 530 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNRF2Q8NHG8 242 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCGB1C1Q8TD33 95 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM210BQ96KR6 192 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC00477Q96M19 166 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 C20orf144Q9BQM9 153 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 PYGO2Q9BRQ0 406 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 SH3BGRL3Q9H299 93 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRELID1Q9Y255 219 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa3.03□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa3.03□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa3.03□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTTG1O95997 202 aa3.03□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF138P52744 262 aa3.03□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 TCL1AP56279 114 aa3.03□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAS2R45P59539 299 aa3.03□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 HERV-K104P63124 156 aa3.03□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 LGALS9BQ3B8N2 356 aa3.03□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNF212Q495C1 297 aa3.03□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 SOHLH1Q5JUK2 328 aa3.03□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF493Q6ZR52 646 aa3.03□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 C6orf223Q8N319 242 aa3.03□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC00612Q8N6U2 182 aa3.03□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM75Q8N9X5 138 aa3.03□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 CMTM2Q8TAZ6 248 aa3.03□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM19A4Q96LR4 140 aa3.03□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 MED28Q9H204 178 aa3.03□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF492Q9P255 531 aa3.03□□□□□ -1.92
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa3.02□□□□□ -1.93
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa3.02□□□□□ -1.93
RPS3AP54-201ENST00000435535 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa3.02□□□□□ -1.93
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1B0GV50 99 aa3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 148.2 ms