RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358355.5

USP20-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP20, Length 4,371 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-202ENST00000358355 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa10.04□□□□□ -0.8
USP20-202ENST00000358355 TEX22C9J3V5 150 aa10.04□□□□□ -0.8
USP20-202ENST00000358355 LTAP01374 205 aa10.04□□□□□ -0.8
USP20-202ENST00000358355 M0R2P5 195 aa10.04□□□□□ -0.8
USP20-202ENST00000358355 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
USP20-202ENST00000358355 IGLV2-23P01705 113 aa10.04□□□□□ -0.8
USP20-202ENST00000358355 ZMAT4Q9H898 229 aa10.04□□□□□ -0.8
USP20-202ENST00000358355 PTPRBP23467 1997 aa10.04□□□□□ -0.8
USP20-202ENST00000358355 hDV102S1A0JD36 115 aa10.04□□□□□ -0.8
USP20-202ENST00000358355 FSTL3O95633 263 aa10.04□□□□□ -0.8
USP20-202ENST00000358355 FN1P02751 2386 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
USP20-202ENST00000358355 PLXNB1O43157 2135 aa10.03□□□□□ -0.8
USP20-202ENST00000358355 K7EMT4 169 aa10.03□□□□□ -0.8
USP20-202ENST00000358355 SMIM2Q9BVW6 85 aa10.03□□□□□ -0.8
USP20-202ENST00000358355 CST9LQ9H4G1 147 aa10.03□□□□□ -0.8
USP20-202ENST00000358355 LINC00574Q9H8X3 128 aa10.03□□□□□ -0.8
USP20-202ENST00000358355 GP9P14770 177 aa10.03□□□□□ -0.8
USP20-202ENST00000358355 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
USP20-202ENST00000358355 TMEM141Q96I45 108 aa10.03□□□□□ -0.8
USP20-202ENST00000358355 ZNF479Q96JC4 524 aa10.03□□□□□ -0.8
USP20-202ENST00000358355 C16orf54Q6UWD8 224 aa10.02□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 PATE2Q6UY27 113 aa10.02□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 GPHB5Q86YW7 130 aa10.02□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 MUC3AQ02505 3323 aa10.02□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 CLPSL1A2RUU4 121 aa10.02□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 PYY3Q5JQD4 70 aa10.02□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 LYPD6BQ8NI32 183 aa10.02□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 CHAC1Q9BUX1 264 aa10.02□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 ZNF493Q6ZR52 646 aa10.02□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 CENPEQ02224 2701 aa10.01□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa10.01□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 A0A087WW49 117 aa10.01□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 A6NDX4 124 aa10.01□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 PMVKQ15126 192 aa10.01□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 IGLV2-14P01704 120 aa10.01□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 MYCNOSP40205 109 aa10.01□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 RNF152Q8N8N0 203 aa10.01□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 RHOHQ15669 191 aa10□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 C10orf91Q5T1B1 145 aa10□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 C20orf78Q9BR46 151 aa10□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 C2orf70A6NJV1 201 aa10□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa10□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa10□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 GNRH2O43555 120 aa10□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 APRG1Q8IVJ8 170 aa10□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa10□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 U3KQE9 123 aa10□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa9.99□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 PROP1O75360 226 aa9.99□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 HLA-DRB4P13762 266 aa9.99□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa9.99□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa9.99□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 E7EUB6 86 aa9.99□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 NPYP01303 97 aa9.99□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 ESDP10768 282 aa9.99□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 NPC2P61916 151 aa9.99□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 GAGE6Q13070 117 aa9.99□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 PIFOQ8TCI5 191 aa9.99□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 MTORP42345 2549 aa9.98□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 TRAV25A0A0B4J276 109 aa9.98□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 FANCD2OSQ96PS1 177 aa9.98□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 CHD6Q8TD26 2715 aa9.98□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 ODF3BA8MYP8 253 aa9.98□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 MORN5Q5VZ52 161 aa9.98□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa9.98□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa9.98□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa9.98□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 LEPROTO15243 131 aa9.98□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 TTC32Q5I0X7 151 aa9.98□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa9.98□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 STPG4Q8N801 248 aa9.97□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 MEGF9Q9H1U4 602 aa9.97□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 K7EN84 100 aa9.97□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 ATXN8Q156A1 80 aa9.97□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 WFDC11Q8NEX6 87 aa9.97□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 CFHR4Q92496 578 aa9.97□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 NEGR1Q7Z3B1 354 aa9.97□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 GATD1Q8NB37 220 aa9.97□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 MRAPQ8TCY5 172 aa9.97□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.96□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 RMI2Q96E14 147 aa9.96□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 A0A087X0K7 114 aa9.96□□□□□ -0.81
USP20-202ENST00000358355 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa9.96□□□□□ -0.82
USP20-202ENST00000358355 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
USP20-202ENST00000358355 MPV17L2Q567V2 206 aa9.96□□□□□ -0.82
USP20-202ENST00000358355 ANGP03950 147 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
USP20-202ENST00000358355 ZNF124Q15973 351 aa9.95□□□□□ -0.82
USP20-202ENST00000358355 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa9.95□□□□□ -0.82
USP20-202ENST00000358355 VWC2LB2RUY7 222 aa9.95□□□□□ -0.82
USP20-202ENST00000358355 ASPHD1Q5U4P2 390 aa9.95□□□□□ -0.82
USP20-202ENST00000358355 TSPAN13O95857 204 aa9.95□□□□□ -0.82
USP20-202ENST00000358355 IGHV4-31P0DP07 118 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.9 ms