RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 IGLC3P0DOY3 106 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 SIGMAR1Q99720 223 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 CLPSL1A2RUU4 121 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
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SH3BP4-201ENST00000344528 NCKAP5O14513 1909 aa12.65□□□□□ -0.38
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SH3BP4-201ENST00000344528 A0A0J9YY99 117 aa12.64□□□□□ -0.39
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SH3BP4-201ENST00000344528 C4orf3Q8WVX3 66 aa12.62□□□□□ -0.39
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SH3BP4-201ENST00000344528 C19orf84I3L1E1 186 aa12.61□□□□□ -0.39
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SH3BP4-201ENST00000344528 TAL2Q16559 108 aa12.6□□□□□ -0.39
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SH3BP4-201ENST00000344528 SPINK8P0C7L1 97 aa12.59□□□□□ -0.39
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SH3BP4-201ENST00000344528 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
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SH3BP4-201ENST00000344528 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa12.58□□□□□ -0.4
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SH3BP4-201ENST00000344528 XCL1P47992 114 aa12.58□□□□□ -0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 DKK2Q9UBU2 259 aa12.58□□□□□ -0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 ICOSQ9Y6W8 199 aa12.58□□□□□ -0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa12.58□□□□□ -0.4
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SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 H3BMM0 161 aa12.57□□□□□ -0.4
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SH3BP4-201ENST00000344528 GYPEP15421 78 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 UBE2WQ96B02 151 aa12.57□□□□□ -0.4
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SH3BP4-201ENST00000344528 C1orf43Q9BWL3 253 aa12.57□□□□□ -0.4
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SH3BP4-201ENST00000344528 OCIAD2Q56VL3 154 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 C22orf34Q6ZV56 151 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 DENND4AQ7Z401 1863 aa12.56□□□□□ -0.4
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SH3BP4-201ENST00000344528 MED14OSP0DP75 135 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 Q8N1Y9 231 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM61Q8N0U2 210 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 SIVA1O15304 175 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 PRR14LQ5THK1 2151 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 GAGE2AQ6NT46 116 aa12.55□□□□□ -0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 MSRB1Q9NZV6 116 aa12.55□□□□□ -0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 SOCS3O14543 225 aa12.55□□□□□ -0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 IGHG4P01861 327 aa12.55□□□□□ -0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 Q6ZQT7 251 aa12.55□□□□□ -0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC25A29Q8N8R3 303 aa12.55□□□□□ -0.4
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