RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311177.6

HOXB9-201, Transcript of homeobox B9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB9, Length 2,581 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9-201ENST00000311177 MAP1LC3AQ9H492 121 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXB9-201ENST00000311177 FAM223BA6NKX1 122 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXB9-201ENST00000311177 TGFAP01135 160 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXB9-201ENST00000311177 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXB9-201ENST00000311177 FAM223AQ8IWN6 122 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXB9-201ENST00000311177 LINC01356Q8N9X3 169 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXB9-201ENST00000311177 PRO0461Q9UI25 63 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXB9-201ENST00000311177 APOMO95445 188 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXB9-201ENST00000311177 ARL3P36405 182 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXB9-201ENST00000311177 TMEM95Q3KNT9 176 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXB9-201ENST00000311177 TMEM190Q8WZ59 177 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXB9-201ENST00000311177 MXRA5Q9NR99 2828 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB9-201ENST00000311177 RNF223E7ERA6 249 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB9-201ENST00000311177 DPM2O94777 84 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB9-201ENST00000311177 ERCC8Q13216 396 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB9-201ENST00000311177 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB9-201ENST00000311177 HIST1H4GQ99525 98 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB9-201ENST00000311177 IGHV4-59P01825 116 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB9-201ENST00000311177 PF4V1P10720 104 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB9-201ENST00000311177 DEFB112Q30KQ8 113 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB9-201ENST00000311177 PRR25Q96S07 402 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB9-201ENST00000311177 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HOXB9-201ENST00000311177 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXB9-201ENST00000311177 PSMG4Q5JS54 123 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXB9-201ENST00000311177 SYT8Q8NBV8 401 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXB9-201ENST00000311177 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXB9-201ENST00000311177 TMEM158Q8WZ71 300 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXB9-201ENST00000311177 GATA3P23771 443 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXB9-201ENST00000311177 RRN3P1Q2M238 152 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXB9-201ENST00000311177 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXB9-201ENST00000311177 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXB9-201ENST00000311177 RNF185Q96GF1 192 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXB9-201ENST00000311177 TEX15Q9BXT5 2789 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXB9-201ENST00000311177 APCP25054 2843 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXB9-201ENST00000311177 TNFRSF6BO95407 300 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXB9-201ENST00000311177 SPINK8P0C7L1 97 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXB9-201ENST00000311177 C8orf86Q6ZUL3 223 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXB9-201ENST00000311177 U3KQE9 123 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXB9-201ENST00000311177 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXB9-201ENST00000311177 FOXI1Q12951 378 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXB9-201ENST00000311177 CDIP1Q9H305 208 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXB9-201ENST00000311177 CREBBPQ92793 2442 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB9-201ENST00000311177 MT-ATP8P03928 68 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB9-201ENST00000311177 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXB9-201ENST00000311177 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB9-201ENST00000311177 ATP5LO75964 103 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB9-201ENST00000311177 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXB9-201ENST00000311177 SLC50A1Q9BRV3 221 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB9-201ENST00000311177 TENM4Q6N022 2769 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB9-201ENST00000311177 TAL2Q16559 108 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB9-201ENST00000311177 C10orf99Q6UWK7 81 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB9-201ENST00000311177 IL17RELQ6ZVW7 336 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB9-201ENST00000311177 ORM1P02763 201 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 SFTA2Q6UW10 78 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 NFE4Q86UQ8 179 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 GLMPQ8WWB7 406 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 USMG5Q96IX5 58 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 CHD6Q8TD26 2715 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 LINC01546A6NGU7 62 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 IGLV1-40P01703 118 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 IGLC6P0CF74 106 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 FHL3Q13643 280 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 CYSLTR1Q9Y271 337 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 HLA-DRB4P13762 266 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 COX8CQ7Z4L0 72 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 ZNF575Q86XF7 245 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 H3BUA1 57 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 NDUFA4O00483 81 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 IGHV4-31P0DP07 118 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 CFHR3Q02985 330 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 C16orf92Q96LL3 132 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 TLN2Q9Y4G6 2542 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 CR1P17927 2039 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 XGP55808 180 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 DEFB113Q30KQ7 82 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 CFAP126Q5VTH2 177 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 MYOZ3Q8TDC0 251 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 J3QLI3 93 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 EDN2P20800 178 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 Q6ZUT4 128 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 C20orf173Q96LM9 149 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 BRI3O95415 125 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 DEFB1P60022 68 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 RPL11P62913 178 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 GPHB5Q86YW7 130 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 PTH2Q96A98 100 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 RNF183Q96D59 192 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 LINC01559Q495D7 138 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 Q6ZQT7 251 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 Q8N8P6 123 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB9-201ENST00000311177 Q96MF0 132 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69 ms