RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 GAGE5Q13069 117 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 GAGE6Q13070 117 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 LINC00305Q7Z4B0 112 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 NUP35Q8NFH5 326 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 BLNKQ8WV28 456 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 CTRLP40313 264 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 CAMPP49913 170 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 C15orf32Q32M92 178 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 GDF5OSQ5U4N7 250 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 OR1L4Q8NGR5 311 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 MYOZ3Q8TDC0 251 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 FXYD5Q96DB9 178 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 ORM2P19652 201 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 SYNJ2BPP57105 145 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 LCN12Q6JVE5 192 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 HIGD1CA8MV81 97 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 MYCNOSP40205 109 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 VSTM2AQ8TAG5 236 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 BORCS7Q96B45 105 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 C5orf17Q8NAS9 161 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 OR1B1Q8NGR6 318 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 H3BTX0 84 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 RS1O15537 224 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 HSBP1O75506 76 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 UBE2G1P62253 170 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM231DQ6ZW35 169 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 LINC01619G3V211 115 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 HYPMO75409 117 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 IGLC2P0DOY2 106 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 IGLC3P0DOY3 106 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 CLEC19AQ6UXS0 136 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 Q6ZN92 141 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 GRAMD2BQ96HH9 432 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 HSPB8Q9UJY1 196 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 IGLC7A0M8Q6 106 aa9.52□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 INS-IGF2F8WCM5 200 aa9.52□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 K7EIL1 84 aa9.52□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa9.52□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 RPS20P60866 119 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 FHL3Q13643 280 aa9.52□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa9.52□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 FANCD2OSQ96PS1 177 aa9.52□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 NDFIP1Q9BT67 221 aa9.52□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 UQCR10Q9UDW1 63 aa9.52□□□□□ -0.88
RABGEF1-209ENST00000607882 OVOL1O14753 267 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 MTURNQ8N3F0 131 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 THAP8Q8NA92 274 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
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RABGEF1-209ENST00000607882 M0R2Z0 102 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
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RABGEF1-209ENST00000607882 OR4A5Q8NH83 315 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP5G2Q06055 141 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 GPR183P32249 361 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 EBLN2Q6P2I7 272 aa9.5□□□□□ -0.89
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RABGEF1-209ENST00000607882 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
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RABGEF1-209ENST00000607882 GPR82Q96P67 336 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 PMCHL1Q16048 86 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF580Q9UK33 172 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A087WX48 190 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 OR2T8A6NH00 312 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A0G2JLM5 398 aa9.48□□□□□ -0.89
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RABGEF1-209ENST00000607882 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa9.48□□□□□ -0.89
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RABGEF1-209ENST00000607882 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa9.48□□□□□ -0.89
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RABGEF1-209ENST00000607882 HBBP68871 147 aa9.48□□□□□ -0.89
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RABGEF1-209ENST00000607882 GTSF1Q8WW33 167 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 PGLYRP4Q96LB8 373 aa9.48□□□□□ -0.89
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RABGEF1-209ENST00000607882 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 SPATA12Q7Z6I5 190 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 MLST8Q9BVC4 326 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 Q9H3A6 140 aa9.47□□□□□ -0.89
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