RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.69□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 IGLV2-8P01709 118 aa8.69□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 IGHV3-7P01780 117 aa8.69□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 AESQ08117 197 aa8.69□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 CATR1Q13166 79 aa8.69□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 EDDM3AQ14507 147 aa8.69□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 CEACAM21Q3KPI0 293 aa8.69□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 OR9G1Q8NH87 305 aa8.69□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 GTSF1Q8WW33 167 aa8.69□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 PIGCQ92535 297 aa8.69□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.69□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 APLNQ9ULZ1 77 aa8.69□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.69□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.68□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa8.68□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 C16orf90A8MZG2 172 aa8.68□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 IGLV2-14P01704 120 aa8.68□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 INAFM2P0DMQ5 153 aa8.68□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 HLA-DRB4P13762 266 aa8.68□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 ERVK11-1P61568 191 aa8.68□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 LGALS9BQ3B8N2 356 aa8.68□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.68□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 PSG8Q9UQ74 426 aa8.68□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa8.68□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 C15orf62A8K5M9 175 aa8.67□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 G3V318 75 aa8.67□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 J3QT63 122 aa8.67□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 CD7P09564 240 aa8.67□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 TAL2Q16559 108 aa8.67□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 Q6P435 159 aa8.67□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 C18orf15Q96N68 181 aa8.67□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 SPXQ9BT56 116 aa8.67□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.67□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa8.67□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 E9PLD3 99 aa8.66□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 RRHO14718 337 aa8.66□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 MFAP2P55001 183 aa8.66□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 TAS2R45P59539 299 aa8.66□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 HBBP68871 147 aa8.66□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 GATD1Q8NB37 220 aa8.66□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 S1PR3Q99500 378 aa8.66□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.66□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 PRSS46E5RG02 174 aa8.65□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 CSN1S1P47710 185 aa8.65□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 RPL8P62917 257 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 LINC01559Q495D7 138 aa8.65□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 C19orf54Q5BKX5 351 aa8.65□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 NUP35Q8NFH5 326 aa8.65□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
HCG18-241ENST00000602290 CLEC3BP05452 202 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 TMEM177Q53S58 311 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 GDF5OSQ5U4N7 250 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 MGST2Q99735 147 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 ZNF492Q9P255 531 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 A0A1B0GW15 77 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 EPM2AB3EWF7 344 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 H3BMG7 143 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 ATP6V0E1O15342 81 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 GPHA2Q96T91 129 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 RASL11BQ9BPW5 248 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 TM2D2Q9BX73 214 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 OR1A1Q9P1Q5 309 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 IL36RNQ9UBH0 155 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa8.62□□□□□ -1.03
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HCG18-241ENST00000602290 CSN3P07498 182 aa8.62□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 SPINK8P0C7L1 97 aa8.62□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 BCL3P20749 454 aa8.62□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 ARL3P36405 182 aa8.62□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.62□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa8.62□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 RNF213Q63HN8 5207 aa8.61□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 TRAV41A0A0B4J266 112 aa8.61□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa8.61□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 ZNF785A8K8V0 405 aa8.61□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 TMEM262E9PQX1 116 aa8.61□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 MGST3O14880 152 aa8.61□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 SPINK4O60575 86 aa8.61□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 CA1P00915 261 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 IGHV3-11P01762 117 aa8.61□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 RBMY1CP0DJD4 496 aa8.61□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 MGST1P10620 155 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 LINC00205P59089 165 aa8.61□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 FXYD3Q14802 87 aa8.61□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 C17orf58Q2M2W7 97 aa8.61□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 MIC13Q5XKP0 118 aa8.61□□□□□ -1.03
HCG18-241ENST00000602290 Q6Q795 121 aa8.61□□□□□ -1.03
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