RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1-208ENST00000586667 TYMSP04818 313 aa9.04□□□□□ -0.96
DNMT1-208ENST00000586667 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
DNMT1-208ENST00000586667 MGST1P10620 155 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
DNMT1-208ENST00000586667 MIFP14174 115 aa9.04□□□□□ -0.96
DNMT1-208ENST00000586667 RPL23P62829 140 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
DNMT1-208ENST00000586667 RPL19P84098 196 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
DNMT1-208ENST00000586667 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
DNMT1-208ENST00000586667 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
DNMT1-208ENST00000586667 NAT8Q9UHE5 227 aa9.04□□□□□ -0.96
DNMT1-208ENST00000586667 NAGKQ9UJ70 344 aa9.04□□□□□ -0.96
DNMT1-208ENST00000586667 SMIM9A6NGZ8 99 aa9.03□□□□□ -0.96
DNMT1-208ENST00000586667 FABP5P3A8MUU1 101 aa9.03□□□□□ -0.96
DNMT1-208ENST00000586667 KRBOX1C9JBD0 128 aa9.03□□□□□ -0.96
DNMT1-208ENST00000586667 C10orf91Q5T1B1 145 aa9.03□□□□□ -0.96
DNMT1-208ENST00000586667 ISOC2Q96AB3 205 aa9.03□□□□□ -0.96
DNMT1-208ENST00000586667 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
DNMT1-208ENST00000586667 SDF2L1Q9HCN8 221 aa9.03□□□□□ -0.96
DNMT1-208ENST00000586667 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.96
DNMT1-208ENST00000586667 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa9.02□□□□□ -0.97
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DNMT1-208ENST00000586667 RRN3P1Q2M238 152 aa9.02□□□□□ -0.97
DNMT1-208ENST00000586667 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa9.02□□□□□ -0.97
DNMT1-208ENST00000586667 ZMAT4Q9H898 229 aa9.02□□□□□ -0.97
DNMT1-208ENST00000586667 MDFICQ9P1T7 246 aa9.02□□□□□ -0.97
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DNMT1-208ENST00000586667 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
DNMT1-208ENST00000586667 HTN1P15515 57 aa9.01□□□□□ -0.97
DNMT1-208ENST00000586667 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
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DNMT1-208ENST00000586667 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
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DNMT1-208ENST00000586667 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa9□□□□□ -0.97
DNMT1-208ENST00000586667 B4DEV8 164 aa9□□□□□ -0.97
DNMT1-208ENST00000586667 ORM1P02763 201 aa9□□□□□ -0.97
DNMT1-208ENST00000586667 TCL1AP56279 114 aa9□□□□□ -0.97
DNMT1-208ENST00000586667 ADIRFQ15847 76 aa9□□□□□ -0.97
DNMT1-208ENST00000586667 DNLZQ5SXM8 178 aa9□□□□□ -0.97
DNMT1-208ENST00000586667 ZNF493Q6ZR52 646 aa9□□□□□ -0.97
DNMT1-208ENST00000586667 C9orf85Q96MD7 179 aa9□□□□□ -0.97
DNMT1-208ENST00000586667 SEC11CQ9BY50 192 aa9□□□□□ -0.97
DNMT1-208ENST00000586667 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa9□□□□□ -0.97
DNMT1-208ENST00000586667 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.99□□□□□ -0.97
DNMT1-208ENST00000586667 P01737 135 aa8.99□□□□□ -0.97
DNMT1-208ENST00000586667 CXCL1P09341 107 aa8.99□□□□□ -0.97
DNMT1-208ENST00000586667 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.99□□□□□ -0.97
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DNMT1-208ENST00000586667 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
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DNMT1-208ENST00000586667 GRIFINA4D1Z8 144 aa8.98□□□□□ -0.97
DNMT1-208ENST00000586667 F8W036 122 aa8.98□□□□□ -0.97
DNMT1-208ENST00000586667 IGLC6P0CF74 106 aa8.98□□□□□ -0.97
DNMT1-208ENST00000586667 GZMBP10144 247 aa8.98□□□□□ -0.97
DNMT1-208ENST00000586667 ZNF415Q09FC8 603 aa8.98□□□□□ -0.97
DNMT1-208ENST00000586667 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
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DNMT1-208ENST00000586667 OR2D3Q8NGH3 330 aa8.98□□□□□ -0.97
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DNMT1-208ENST00000586667 V9GYV3 84 aa8.98□□□□□ -0.97
DNMT1-208ENST00000586667 TMEM189A5PLL7 270 aa8.97□□□□□ -0.97
DNMT1-208ENST00000586667 H3BVH4 76 aa8.97□□□□□ -0.97
DNMT1-208ENST00000586667 ASIPP42127 132 aa8.97□□□□□ -0.97
DNMT1-208ENST00000586667 EMP1P54849 157 aa8.97□□□□□ -0.97
DNMT1-208ENST00000586667 ERVFC1-1P60608 527 aa8.97□□□□□ -0.97
DNMT1-208ENST00000586667 CT83Q5H943 113 aa8.97□□□□□ -0.97
DNMT1-208ENST00000586667 FAM222AQ5U5X8 452 aa8.97□□□□□ -0.97
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DNMT1-208ENST00000586667 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.96□□□□□ -0.97
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DNMT1-208ENST00000586667 CTRLP40313 264 aa8.96□□□□□ -0.98
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DNMT1-208ENST00000586667 IL36BQ9NZH7 164 aa8.96□□□□□ -0.98
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DNMT1-208ENST00000586667 Q6ZTI0 123 aa8.95□□□□□ -0.98
DNMT1-208ENST00000586667 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
DNMT1-208ENST00000586667 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
DNMT1-208ENST00000586667 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
DNMT1-208ENST00000586667 NACAE9PAV3 2078 aa8.94□□□□□ -0.98
DNMT1-208ENST00000586667 SNURFLB1AK76 121 aa8.94□□□□□ -0.98
DNMT1-208ENST00000586667 GATCO43716 136 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
DNMT1-208ENST00000586667 OR5AL1P0C617 328 aa8.94□□□□□ -0.98
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