RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555617.5

ABCD4-222, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-222	ENST00000555617	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	LGI3	Q8N145	548 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	IFT46	Q9NQC8	304 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	PRR34	Q9NV39	138 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	LINC00846	Q9NV44	126 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	TBP	P20226	339 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	RCVRN	P35243	200 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	AKR1C2	P52895	323 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	TAS2R46	P59540	309 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	RAB31	Q13636	194 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	GUK1	Q16774	197 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM219A	Q8IW50	185 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617		M0R3E3	92 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	INPP1	P49441	399 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	IL18	Q14116	193 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	LCN15	Q6UWW0	184 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617		V9GYH0	126 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	FABP1	P07148	127 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	BORCS5	Q969J3	196 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM262	E9PQX1	116 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	GNRH2	O43555	120 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	PMP2	P02689	132 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	CD3D	P04234	171 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	CXCL2	P19875	107 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	TAS2R19	P59542	299 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	TP53RK	Q96S44	253 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617		H3BQ15	152 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	TSHB	P01222	138 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	MT2A	P02795	61 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	UCP3	P55916	312 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	PYDC2	Q56P42	97 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	SRR	Q9GZT4	340 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	RAB3D	O95716	219 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	AKAIN1	P0CW23	69 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	RAB5C	P51148	216 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	AP3S2	P59780	193 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	PATE2	Q6UY27	113 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		6.19	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	MT1F	P04733	61 aa		6.19	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	XP32	Q5T750	250 aa		6.19	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		6.19	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		6.19	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		6.19	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	TERB2	Q8NHR7	220 aa		6.19	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	S100Z	Q8WXG8	99 aa		6.19	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	6.18	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	DISC1	C4P0D8	188 aa		6.18	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	6.18	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	6.18	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	6.18	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		6.18	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	6.18	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	PRRT1	Q99946	306 aa		6.18	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		6.18	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		6.17	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	IGLC2	P0DOY2	106 aa		6.17	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	S100G	P29377	79 aa		6.17	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	PTTG1IP	P53801	180 aa		6.17	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	RND3	P61587	244 aa		6.17	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	6.17	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF546	Q86UE3	836 aa		6.17	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		6.17	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		6.17	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	CCDC32	Q9BV29	185 aa		6.17	□□□□□ -1.42
ABCD4-222	ENST00000555617	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		6.17	□□□□□ -1.42

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