RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 SIX6O95475 246 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 CMTM2Q8TAZ6 248 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 TMED6Q8WW62 240 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 FAM30AQ9NZY2 134 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 TRAV21A0A0B4J279 112 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 PGPA6NDG6 321 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 IGHV3-30P01768 117 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 IGHV3-33P01772 117 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 TYMSP04818 313 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 PFN1P07737 140 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 TAS2R45P59539 299 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 KHDC3LQ587J8 217 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 FFAR4Q5NUL3 377 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 NMES1Q9C002 83 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 F6UZH7 168 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 FAM74A1Q5RGS3 127 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 SLC25A29Q8N8R3 303 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 PRADC1Q9BSG0 188 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 SDF2L1Q9HCN8 221 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 OTORQ9NRC9 128 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 BOLA1Q9Y3E2 137 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 H0YIZ8 118 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP11.33□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 MZT2BQ6NZ67 158 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 KCNS1Q96KK3 526 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 ATP5SQ99766 215 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 TREM1Q9NP99 234 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 MBD2Q9UBB5 411 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 RHOHQ15669 191 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 ZNF876PQ49A33 203 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 ASB13Q8WXK3 278 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 CCDC32Q9BV29 185 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 LELP1Q5T871 98 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 SCGB1C1Q8TD33 95 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 TVP23CQ96ET8 276 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 RS1O15537 224 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 C1QBP02746 253 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 CFAP126Q5VTH2 177 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 TM2D2Q9BX73 214 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 CIDEAO60543 219 aa11.29□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 CYCSP99999 105 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 DPPA3Q6W0C5 159 aa11.29□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa11.29□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 SGK494Q96LW2 274 aa11.29□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 SMIM3Q9BZL3 60 aa11.29□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 GTSF1LQ9H1H1 148 aa11.29□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 A0A1W2PPV4 95 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 GNG5P63218 68 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 WFDC2Q14508 124 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 LINC00528Q8N1L1 170 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 HSPB11Q9Y547 144 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-214ENST00000548849 LAGE3Q14657 143 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 PQLC2Q6ZP29 291 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 ENKURQ8TC29 256 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 NDFIP1Q9BT67 221 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 LECT2O14960 151 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 ASAH1Q13510 395 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 PGPEP1LA6NFU8 196 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 TAAR5O14804 337 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 MGST1P10620 155 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 Q6ZSA8 131 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 Q8N3U1 123 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 C11orf21Q9P2W6 132 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 RPL12P30050 165 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 H2BFSP57053 126 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 ZNF506Q5JVG8 444 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 TMEM75Q8N9X5 138 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 C9orf85Q96MD7 179 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 MPC2O95563 127 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 GCGP01275 180 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 PET100P0DJ07 73 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 RAB2AP61019 212 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 SH3BGRL3Q9H299 93 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 NDUFA13Q9P0J0 144 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 GAGE12JA6NER3 117 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 GAGE1Q13065 139 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 GAGE4Q13068 117 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 GAGE5Q13069 117 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-214ENST00000548849 GAGE13Q4V321 117 aa11.22□□□□□ -0.61
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