RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LINC00173Q6ZV60 143 aa4.06□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRNTQ86SH4 94 aa4.06□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.06□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MYOZ3Q8TDC0 251 aa4.06□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C2orf50Q96LR7 162 aa4.06□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GGTLC1Q9BX51 225 aa4.06□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CLEC7AQ9BXN2 247 aa4.06□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM191AQ9H0A3 160 aa4.06□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TUBA4BQ9H853 241 aa4.06□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TAS2R8Q9NYW2 309 aa4.06□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa4.05□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 A0A087WW49 117 aa4.05□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa4.05□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BBIP1A8MTZ0 92 aa4.05□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa4.05□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GABARAPH6UMI1 98 aa4.05□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 M0R381 172 aa4.05□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGLV1-51P01701 117 aa4.05□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRAPPC2P0DI81 140 aa4.05□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRAPPC2BP0DI82 140 aa4.05□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PSMB8P28062 276 aa4.05□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OPRK1P41145 380 aa4.05□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 INPP1P49441 399 aa4.05□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GNG11P61952 73 aa4.05□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 Q6ZS49 121 aa4.05□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 YIPF7Q8N8F6 280 aa4.05□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C5orf17Q8NAS9 161 aa4.05□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SUMF2Q8NBJ7 301 aa4.05□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM243Q9BU79 118 aa4.05□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SCRT2Q9NQ03 307 aa4.05□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAT1Q14517 4588 aa4.05□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARRDC5A6NEK1 342 aa4.04□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RBP4P02753 201 aa4.04□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SHBGP04278 402 aa4.04□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF19P17023 458 aa4.04□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ETV6P41212 452 aa4.04□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RBM11P57052 281 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TPPP2P59282 170 aa4.04□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MSMO1Q15800 293 aa4.04□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF773Q6PK81 442 aa4.04□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF714Q96N38 554 aa4.04□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 YPEL4Q96NS1 127 aa4.04□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DERL1Q9BUN8 251 aa4.04□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRO1933Q9H354 126 aa4.04□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF286AQ9HBT8 521 aa4.04□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OTORQ9NRC9 128 aa4.04□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCDC167Q9P0B6 97 aa4.04□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DPM3Q9P2X0 92 aa4.04□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AK3Q9UIJ7 227 aa4.04□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa4.03□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa4.03□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa4.03□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LGALS9O00182 355 aa4.03□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRASP01116 189 aa4.03□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGLV1-47P01700 117 aa4.03□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CD14P08571 375 aa4.03□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SCGB1C2P0DMR2 95 aa4.03□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EDDM3BP56851 147 aa4.03□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa4.03□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HES1Q14469 280 aa4.03□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LINC00299Q6ZSB3 139 aa4.03□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LINC00596Q86U02 117 aa4.03□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NR2C2APQ86WQ0 139 aa4.03□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF645Q8N7E2 425 aa4.03□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR5D14Q8NGL3 314 aa4.03□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SCGB1C1Q8TD33 95 aa4.03□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ABHD14BQ96IU4 210 aa4.03□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RPRMQ9NS64 109 aa4.03□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CACNG5Q9UF02 275 aa4.03□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RNF213Q63HN8 5207 aa4.03□□□□□ -1.76
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 M0R1X1 148 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COX7A2P2O60397 106 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGKV1D-33P01593 117 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGKV1-33P01594 117 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRGC2P03986 189 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMBIM6P55061 237 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GABARAPL2P60520 117 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF146Q15072 292 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KIAA1644Q3SXP7 199 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FOXI2Q6ZQN5 318 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPTSSAQ969W0 71 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPIN2AQ99865 258 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.7 ms