RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 SOCS3O14543 225 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-202ENST00000420808 SPANXN1Q5VSR9 72 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-202ENST00000420808 OR2K2Q8NGT1 345 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-202ENST00000420808 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-202ENST00000420808 LRRK2Q5S007 2527 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-202ENST00000420808 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-202ENST00000420808 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-202ENST00000420808 A6NDX4 124 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-202ENST00000420808 M0R381 172 aa11.8□□□□□ -0.52
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NISCH-202ENST00000420808 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
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NISCH-202ENST00000420808 C9orf139Q6ZV77 190 aa11.78□□□□□ -0.52
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NISCH-202ENST00000420808 ZNF462Q96JM2 2506 aa11.78□□□□□ -0.52
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NISCH-202ENST00000420808 LINC01546A6NGU7 62 aa11.77□□□□□ -0.52
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NISCH-202ENST00000420808 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa11.77□□□□□ -0.53
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NISCH-202ENST00000420808 Q8N8P6 123 aa11.77□□□□□ -0.53
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NISCH-202ENST00000420808 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa11.77□□□□□ -0.53
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NISCH-202ENST00000420808 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
NISCH-202ENST00000420808 K7EMI3 77 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-202ENST00000420808 SMIM17P0DL12 118 aa11.76□□□□□ -0.53
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NISCH-202ENST00000420808 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
NISCH-202ENST00000420808 OR4C5Q8NGB2 326 aa11.75□□□□□ -0.53
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NISCH-202ENST00000420808 A1L4Q6 167 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-202ENST00000420808 IGLV1-40P01703 118 aa11.74□□□□□ -0.53
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NISCH-202ENST00000420808 ZMAT4Q9H898 229 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-202ENST00000420808 JPT2Q9H910 190 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-202ENST00000420808 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-202ENST00000420808 PRB1P04280 392 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-202ENST00000420808 RASL10AQ92737 203 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-202ENST00000420808 DPF1Q92782 380 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-202ENST00000420808 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa11.73□□□□□ -0.53
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NISCH-202ENST00000420808 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa11.73□□□□□ -0.53
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NISCH-202ENST00000420808 LINC00477Q96M19 166 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-202ENST00000420808 MGPP08493 103 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-202ENST00000420808 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
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NISCH-202ENST00000420808 CFHR3Q02985 330 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-202ENST00000420808 DEFB112Q30KQ8 113 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-202ENST00000420808 USMG5Q96IX5 58 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-202ENST00000420808 FAM19A4Q96LR4 140 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-202ENST00000420808 TLN2Q9Y4G6 2542 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-202ENST00000420808 TRAV21A0A0B4J279 112 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-202ENST00000420808 AKAP9Q99996 3911 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-202ENST00000420808 IGKV3-20P01619 116 aa11.71□□□□□ -0.54
NISCH-202ENST00000420808 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa11.71□□□□□ -0.54
NISCH-202ENST00000420808 OVOL1O14753 267 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-202ENST00000420808 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-202ENST00000420808 ATP6V0BQ99437 205 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-202ENST00000420808 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
NISCH-202ENST00000420808 NDUFS8O00217 210 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-202ENST00000420808 ASIPP42127 132 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-202ENST00000420808 DUX5Q96PT3 197 aa11.7□□□□□ -0.54
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