RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 VWC2Q2TAL6 325 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-171P-201ENST00000384354 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-171P-201ENST00000384354 TDRG1Q3Y452 100 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-171P-201ENST00000384354 LINC01559Q495D7 138 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-171P-201ENST00000384354 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-171P-201ENST00000384354 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-171P-201ENST00000384354 ATRAIDQ6UW56 229 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-171P-201ENST00000384354 ENHOQ6UWT2 76 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM159AQ6UWV7 190 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-171P-201ENST00000384354 SDIM1Q6ZPB5 146 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-171P-201ENST00000384354 NIT1Q86X76 327 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-171P-201ENST00000384354 Q8N976 141 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-171P-201ENST00000384354 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-171P-201ENST00000384354 LINC01600Q96MT4 127 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-171P-201ENST00000384354 SCGB3A2Q96PL1 93 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-171P-201ENST00000384354 BCL7BQ9BQE9 202 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-171P-201ENST00000384354 PAXXQ9BUH6 204 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-171P-201ENST00000384354 GSKIPQ9P0R6 139 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRELID1Q9Y255 219 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-171P-201ENST00000384354 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-171P-201ENST00000384354 V9GYH0 126 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-171P-201ENST00000384354 GGTLC3B5MD39 225 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 DIRC3C9JPN6 131 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 HLA-DQA1P01909 254 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLPIP03973 132 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 NBEAP1P0C6P0 100 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 BTCP35070 178 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 RPL29P47914 159 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 GNG5P63218 68 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 BAXQ07812 192 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF876PQ49A33 203 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 C4orf48Q5BLP8 95 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 UFSP1Q6NVU6 142 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 CLPSL2Q6UWE3 100 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 Q6ZRG5 221 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 SH2D6Q7Z4S9 175 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR1L4Q8NGR5 311 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR2T35Q8NGX2 323 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 THAP6Q8TBB0 222 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 C15orf40Q8WUR7 153 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 LINC00479Q96M42 142 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 C9orf85Q96MD7 179 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 C20orf85Q9H1P6 137 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 PARLQ9H300 379 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A087WYN8 130 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A0J9YXV3 536 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 FABP12A6NFH5 140 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 TAS2R30P59541 319 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 RANP62826 216 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 MPV17L2Q567V2 206 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 C9orf163Q8N9P6 203 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 HYLS1Q96M11 299 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 PFDN5Q99471 154 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRADC1Q9BSG0 188 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 GGACTQ9BVM4 153 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 NPCDR1Q9BY65 106 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 AAMDCQ9H7C9 122 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 VCX3AQ9NNX9 186 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 UQCC1Q9NVA1 299 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 INPP1P49441 399 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 BCAP31P51572 246 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRR3P79522 188 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 PYDC2Q56P42 97 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 S100A7AQ86SG5 101 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 TOMM5Q8N4H5 51 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPACA4Q8TDM5 124 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 ASB13Q8WXK3 278 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR51M1Q9H341 326 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 SDF2L1Q9HCN8 221 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 RNF24Q9Y225 148 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 RBAKDNA6NC62 111 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR7C2O60412 319 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 NDUFB6O95139 128 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 MGST1P10620 155 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 NHLH2Q02577 135 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 TOR2AQ5JU69 321 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM252Q8N6L7 170 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 C15orf54Q8N8G6 183 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 SEC22CQ9BRL7 303 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 TREM1Q9NP99 234 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRAV21A0A0B4J279 112 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A0D9SG52 128 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM25EA8MYX2 175 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 L7N2F9 121 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAUP35544 74 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-171P-201ENST00000384354 SULT1A1P50225 295 aa3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 140.3 ms