RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 TFF1P04155 84 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 V9GYV3 84 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 A0A0U1RRA0 63 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 OCIAD2Q56VL3 154 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 CRLF1O75462 422 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 CHD8Q9HCK8 2581 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 NPBQ8NG41 125 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 DKK1O94907 266 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 IGLV3-1P01715 115 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 RNF223E7ERA6 249 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 C9JAW5 83 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 SUMO4Q6EEV6 95 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 IGHV2-5P01817 119 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 PRSS57Q6UWY2 283 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 FXYD5Q96DB9 178 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 WT1-ASQ06250 92 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 J3QQQ9 107 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 IGLC1P0CG04 106 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 CXCL5P42830 114 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 PYY3Q5JQD4 70 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 C8orf49Q96NF6 230 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 SLC25A29Q8N8R3 303 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 U3KQA8 63 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.78□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 J3QKU1 62 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM258P61165 79 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 SPINK13Q1W4C9 94 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM89A2RUT3 159 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 UBE2E2Q96LR5 201 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 H0YGX0 51 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 ADCYAP1P18509 176 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 NPC2P61916 151 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 C11orf44Q8N8P7 122 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 IGHV3-53P01767 116 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 CEND1Q8N111 149 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 FAM215AQ9Y5M1 114 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 AGRNO00468 2067 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 DSCAML1Q8TD84 2053 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 PRSS29PA6NIE9 313 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 C22orf46C9J442 243 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 CFHR4Q92496 578 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 GAGE12JA6NER3 117 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 GAGE4Q13068 117 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 GAGE5Q13069 117 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 PIP4P1Q86T03 277 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 Q96MF0 132 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 XCL2Q9UBD3 114 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 TRAV25A0A0B4J276 109 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 IGLC7A0M8Q6 106 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 CR1LQ2VPA4 569 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF664Q8N3J9 261 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 LYPD6BQ8NI32 183 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 A0A0G2JRQ6 117 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 LHBP01229 141 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 C9orf66Q5T8R8 295 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 Q6ZR03 302 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 WDR86Q86TI4 376 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 SMIM20Q8N5G0 67 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 VOPP1Q96AW1 172 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 SCRT2Q9NQ03 307 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 MRAPQ8TCY5 172 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 WFDC12Q8WWY7 111 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 Q6ZWC4 215 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 KLK9Q9UKQ9 250 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 SELENOKQ9Y6D0 94 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 PRR20EP86478 221 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 PRR20CP86479 221 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 PRR20DP86480 221 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 PRR20BP86481 221 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 PRR20AP86496 221 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM213A2RRL7 107 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 C9JQL5 133 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 SMKR1H3BMG3 65 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 FXYD7P58549 80 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 MTORP42345 2549 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 A0A1W2PPM0 123 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 MED14OSP0DP75 135 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 K7EQD1 137 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRT-201ENST00000356100 IGFL2Q6UWQ7 119 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.5 ms