RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 TRGV11A0A075B6L2 103 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM250H0YL14 139 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 GNRH2O43555 120 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 SH2D1AO60880 128 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 GNG4P50150 75 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF674Q2M3X9 581 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 C12orf74Q32Q52 190 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 MLST8Q9BVC4 326 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 TYMSP04818 313 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF415Q09FC8 603 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 Q6ZTC4 211 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 MDFICQ9P1T7 246 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 ORM1P02763 201 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 DEFB130BP0DP73 79 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 DEFB130AP0DP74 79 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 TCL1AP56279 114 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 DAD1P61803 113 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 PRR27Q6MZM9 219 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 PARLQ9H300 379 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 STARD9Q9P2P6 4700 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 C3orf84H3BNL1 204 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 MGST1P10620 155 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 PGPEP1LA6NFU8 196 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 M0R036 132 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 IGLV2-8P01709 118 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 SRP19P09132 144 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 B4DEV8 164 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 PEA15Q15121 130 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 CLLU1Q5K131 121 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 SMIM12Q96EX1 92 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 TENM2Q9NT68 2774 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 GAGE12BA1L429 117 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 GAGE7O76087 117 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 GAGE12FP0CL80 117 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 GAGE12GP0CL81 117 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 GAGE12IP0CL82 117 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 CASC10Q5T4H9 136 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 Q6ZTI0 123 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 C9JCJ5 164 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 TRAV10A0A0B4J240 114 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 NUPR2A6NF83 97 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 KRBOX1C9JBD0 128 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 HTN3P15516 51 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 OR5I1Q13606 314 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 SMIM7Q9BQ49 75 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 SPXQ9BT56 116 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 MUC4Q99102 2169 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 C9JQL5 133 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 SPINK4O60575 86 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 S100A4P26447 101 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 LINC01559Q495D7 138 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 ASIPP42127 132 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 LINC00612Q8N6U2 182 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 OCC1Q8TAD7 63 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 SMDT1Q9H4I9 107 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 BIN3Q9NQY0 253 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 TRGV2A0A075B6R0 118 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 GRIFINA4D1Z8 144 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF727A8MUV8 499 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 RPL19P84098 196 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 LGALS9BQ3B8N2 356 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD4-201ENST00000306324 M0R2P5 195 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXD4-201ENST00000306324 ATP5G1P05496 136 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXD4-201ENST00000306324 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
HOXD4-201ENST00000306324 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
HOXD4-201ENST00000306324 H3BVH4 76 aa15.81■□□□□ 0.12
HOXD4-201ENST00000306324 K7EN84 100 aa15.81■□□□□ 0.12
HOXD4-201ENST00000306324 C9orf85Q96MD7 179 aa15.81■□□□□ 0.12
HOXD4-201ENST00000306324 C19orf71A6NCJ1 209 aa15.8■□□□□ 0.12
HOXD4-201ENST00000306324 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
HOXD4-201ENST00000306324 P01737 135 aa15.79■□□□□ 0.12
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF575Q86XF7 245 aa15.79■□□□□ 0.12
HOXD4-201ENST00000306324 RASL10AQ92737 203 aa15.79■□□□□ 0.12
HOXD4-201ENST00000306324 IL36BQ9NZH7 164 aa15.79■□□□□ 0.12
HOXD4-201ENST00000306324 IGLL5B9A064 214 aa15.78■□□□□ 0.12
HOXD4-201ENST00000306324 F5H768 121 aa15.78■□□□□ 0.12
HOXD4-201ENST00000306324 ARMS2P0C7Q2 107 aa15.78■□□□□ 0.12
HOXD4-201ENST00000306324 FAM74A3Q4VXF1 159 aa15.78■□□□□ 0.12
HOXD4-201ENST00000306324 DNLZQ5SXM8 178 aa15.78■□□□□ 0.12
HOXD4-201ENST00000306324 OR2D3Q8NGH3 330 aa15.78■□□□□ 0.12
HOXD4-201ENST00000306324 LY96Q9Y6Y9 160 aa15.78■□□□□ 0.12
HOXD4-201ENST00000306324 NACAE9PAV3 2078 aa15.78■□□□□ 0.12
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF876PQ49A33 203 aa15.78■□□□□ 0.12
HOXD4-201ENST00000306324 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
HOXD4-201ENST00000306324 IGHV3-53P01767 116 aa15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms