RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 C18orf15Q96N68 181 aa15.68■□□□□ 0.1
UBE2B-201ENST00000265339 FANCD2OSQ96PS1 177 aa15.68■□□□□ 0.1
UBE2B-201ENST00000265339 SPATA25Q9BR10 227 aa15.68■□□□□ 0.1
UBE2B-201ENST00000265339 ESM1Q9NQ30 184 aa15.68■□□□□ 0.1
UBE2B-201ENST00000265339 A0A096LNJ9 63 aa15.68■□□□□ 0.1
UBE2B-201ENST00000265339 INAFM1C9JVW0 142 aa15.68■□□□□ 0.1
UBE2B-201ENST00000265339 K7EQM0 130 aa15.68■□□□□ 0.1
UBE2B-201ENST00000265339 LTAP01374 205 aa15.68■□□□□ 0.1
UBE2B-201ENST00000265339 TRAV41A0A0B4J266 112 aa15.67■□□□□ 0.1
UBE2B-201ENST00000265339 FMC1Q96HJ9 113 aa15.67■□□□□ 0.1
UBE2B-201ENST00000265339 CUBNO60494 3623 aa15.67■□□□□ 0.1
UBE2B-201ENST00000265339 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa15.67■□□□□ 0.1
UBE2B-201ENST00000265339 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa15.67■□□□□ 0.1
UBE2B-201ENST00000265339 ARMS2P0C7Q2 107 aa15.67■□□□□ 0.1
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM95Q3KNT9 176 aa15.67■□□□□ 0.1
UBE2B-201ENST00000265339 FOXI2Q6ZQN5 318 aa15.67■□□□□ 0.1
UBE2B-201ENST00000265339 SH2D6Q7Z4S9 175 aa15.67■□□□□ 0.1
UBE2B-201ENST00000265339 STXBP6Q8NFX7 210 aa15.67■□□□□ 0.1
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1B0GUT8 65 aa15.66■□□□□ 0.1
UBE2B-201ENST00000265339 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
UBE2B-201ENST00000265339 I3L2K1 104 aa15.66■□□□□ 0.1
UBE2B-201ENST00000265339 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa15.65■□□□□ 0.1
UBE2B-201ENST00000265339 ETDBQ3ZM63 59 aa15.65■□□□□ 0.1
UBE2B-201ENST00000265339 K7EIM0 57 aa15.65■□□□□ 0.1
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF414Q96IQ9 312 aa15.65■□□□□ 0.1
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF702PQ9H963 129 aa15.65■□□□□ 0.1
UBE2B-201ENST00000265339 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa15.64■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 TPPP3Q9BW30 176 aa15.64■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 F8W1H4 67 aa15.63■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 TCRAP04437 139 aa15.63■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 ATP5G2Q06055 141 aa15.63■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 RIGQ13278 110 aa15.63■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 MRAP2Q96G30 205 aa15.63■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 NPIPB6E9PJ23 425 aa15.63■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 PPIFP30405 207 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa15.62■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 K7EMI3 77 aa15.62■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 KLK9Q2XQG4 91 aa15.62■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 TTTY13Q9BZ97 58 aa15.62■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF580Q9UK33 172 aa15.62■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 KLK9Q9UKQ9 250 aa15.62■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 S4R3C0 116 aa15.62■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 PRNTQ86SH4 94 aa15.61■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 WFDC3Q8IUB2 231 aa15.61■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 MTURNQ8N3F0 131 aa15.61■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 Q9H3A6 140 aa15.61■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 F8P00451 2351 aa15.61■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 H3BMG7 143 aa15.61■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 DKK2Q9UBU2 259 aa15.61■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa15.6■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 GP9P14770 177 aa15.6■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 CFHR3Q02985 330 aa15.6■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 D6R8Y8 96 aa15.6■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 INSL3P51460 131 aa15.6■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 HILS1P60008 231 aa15.6■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 Q86TA4 180 aa15.6■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 Q8N2B8 174 aa15.6■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 IFI27L1Q96BM0 104 aa15.6■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 FN1P02751 2386 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 TRGV9Q99603 122 aa15.59■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 CHAC1Q9BUX1 264 aa15.59■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 HBDP02042 147 aa15.58■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 ASCL2Q99929 193 aa15.58■□□□□ 0.09
UBE2B-201ENST00000265339 C15orf32Q32M92 178 aa15.58■□□□□ 0.08
UBE2B-201ENST00000265339 AMTNQ6UX39 209 aa15.58■□□□□ 0.08
UBE2B-201ENST00000265339 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa15.57■□□□□ 0.08
UBE2B-201ENST00000265339 IGHV3-23P01764 117 aa15.57■□□□□ 0.08
UBE2B-201ENST00000265339 E9PLD3 99 aa15.57■□□□□ 0.08
UBE2B-201ENST00000265339 F8W735 103 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
UBE2B-201ENST00000265339 IGLV1-40P01703 118 aa15.57■□□□□ 0.08
UBE2B-201ENST00000265339 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
UBE2B-201ENST00000265339 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa15.57■□□□□ 0.08
UBE2B-201ENST00000265339 PRELID3AQ96N28 172 aa15.57■□□□□ 0.08
UBE2B-201ENST00000265339 C10orf99Q6UWK7 81 aa15.56■□□□□ 0.08
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF479Q96JC4 524 aa15.56■□□□□ 0.08
UBE2B-201ENST00000265339 C21orf62Q9NYP8 219 aa15.56■□□□□ 0.08
UBE2B-201ENST00000265339 IGLL5B9A064 214 aa15.56■□□□□ 0.08
UBE2B-201ENST00000265339 CRLF1O75462 422 aa15.56■□□□□ 0.08
UBE2B-201ENST00000265339 TRGV3P03979 118 aa15.56■□□□□ 0.08
UBE2B-201ENST00000265339 Q6ZSV7 163 aa15.56■□□□□ 0.08
UBE2B-201ENST00000265339 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
UBE2B-201ENST00000265339 H3BUA1 57 aa15.55■□□□□ 0.08
UBE2B-201ENST00000265339 BRI3O95415 125 aa15.55■□□□□ 0.08
UBE2B-201ENST00000265339 LYZP61626 148 aa15.55■□□□□ 0.08
UBE2B-201ENST00000265339 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa15.55■□□□□ 0.08
UBE2B-201ENST00000265339 KLK15Q9H2R5 256 aa15.55■□□□□ 0.08
UBE2B-201ENST00000265339 MFAP4P55083 255 aa15.55■□□□□ 0.08
UBE2B-201ENST00000265339 LCNL1Q6ZST4 164 aa15.55■□□□□ 0.08
UBE2B-201ENST00000265339 HIGD1BQ9P298 99 aa15.55■□□□□ 0.08
UBE2B-201ENST00000265339 NF1P21359 2839 aa15.54■□□□□ 0.08
UBE2B-201ENST00000265339 CT45A10P0DMU9 189 aa15.54■□□□□ 0.08
UBE2B-201ENST00000265339 PF4V1P10720 104 aa15.54■□□□□ 0.08
UBE2B-201ENST00000265339 GAGE13Q4V321 117 aa15.54■□□□□ 0.08
UBE2B-201ENST00000265339 FAM223BA6NKX1 122 aa15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms