RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 TENM2Q9NT68 2774 aa8.59□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 KRBOX1C9JBD0 128 aa8.59□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 C9JQL5 133 aa8.59□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 GPX1P07203 203 aa8.59□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 CEBPGP53567 150 aa8.59□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 ZNF124Q15973 351 aa8.59□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 TMEM241Q24JQ0 296 aa8.59□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 CENPWQ5EE01 88 aa8.59□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 ASCL2Q99929 193 aa8.59□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 DERL1Q9BUN8 251 aa8.59□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 SEC11CQ9BY50 192 aa8.59□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 WFDC10AQ9H1F0 79 aa8.59□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 NAT8Q9UHE5 227 aa8.59□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 IGKV3-20P01619 116 aa8.58□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 DEFB1P60022 68 aa8.58□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 ZNF674Q2M3X9 581 aa8.58□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 Q6AWC8 147 aa8.58□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.58□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa8.58□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.57□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 C7orf71A4D174 169 aa8.57□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.57□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 F8W036 122 aa8.57□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 INSP01308 110 aa8.57□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 Q8TAT8 98 aa8.57□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 TVP23CQ96ET8 276 aa8.57□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 SGK494Q96LW2 274 aa8.57□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 U3KQK5 164 aa8.57□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 SORL1Q92673 2214 aa8.57□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa8.56□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 CA1P00915 261 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 PFN1P07737 140 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 SPINK13Q1W4C9 94 aa8.56□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 C10orf91Q5T1B1 145 aa8.56□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 FAM162BQ5T6X4 162 aa8.56□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 Q6ZWC4 215 aa8.56□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.56□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 SDF2L1Q9HCN8 221 aa8.56□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.56□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa8.56□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.55□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 B4DEV8 164 aa8.55□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 C3orf84H3BNL1 204 aa8.55□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 H7BYZ3 331 aa8.55□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 M0R2Z0 102 aa8.55□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 CRXO43186 299 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 GCGP01275 180 aa8.55□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 IGLV2-8P01709 118 aa8.55□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 FAM231DQ6ZW35 169 aa8.55□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 LINC01551Q86U37 167 aa8.55□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 OCC1Q8TAD7 63 aa8.55□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 KCNS1Q96KK3 526 aa8.55□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.55□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 LYSTQ99698 3801 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 MGST1P10620 155 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 C8orf49Q96NF6 230 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 XKRY2A2RUG3 117 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 CXCL1P09341 107 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 RPL23P62829 140 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 TDRG1Q3Y452 100 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 C15orf54Q8N8G6 183 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 NEU1Q99519 415 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 OSTCQ9NRP0 149 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 XCL2Q9UBD3 114 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-211ENST00000488243 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-211ENST00000488243 C19orf71A6NCJ1 209 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-211ENST00000488243 PPP1R2P9O14990 202 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-211ENST00000488243 FXYD7P58549 80 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-211ENST00000488243 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
NISCH-211ENST00000488243 BTN1A1Q13410 526 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-211ENST00000488243 ADIRFQ15847 76 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-211ENST00000488243 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
NISCH-211ENST00000488243 NHLRC2Q8NBF2 726 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-211ENST00000488243 ISOC2Q96AB3 205 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-211ENST00000488243 RNF183Q96D59 192 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-211ENST00000488243 RCHY1Q96PM5 261 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-211ENST00000488243 TMEM208Q9BTX3 173 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-211ENST00000488243 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-211ENST00000488243 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-211ENST00000488243 K7EN84 100 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-211ENST00000488243 SH2D1AO60880 128 aa8.51□□□□□ -1.05
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