RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 RAB19A4D1S5 217 aa8.95□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 PGPA6NDG6 321 aa8.95□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 C9JQL5 133 aa8.95□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 M0R2Z0 102 aa8.95□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 M0R3E3 92 aa8.95□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.95□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.95□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 PCLOQ9Y6V0 5065 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 A8MTW9 85 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 GNG5P63218 68 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 PSG3Q16557 428 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 SPINK13Q1W4C9 94 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 RRN3P1Q2M238 152 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 TMEM88Q6PEY1 159 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 C5orf17Q8NAS9 161 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 TXNDC17Q9BRA2 123 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 AAMDCQ9H7C9 122 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 PRELID1Q9Y255 219 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 PRAC2D3DTV9 90 aa8.93□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 CRXO43186 299 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 SRP19P09132 144 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 CNN1P51911 297 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 DAD1P61803 113 aa8.93□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 LGALS9BQ3B8N2 356 aa8.93□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 Q6ZR54 194 aa8.93□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.93□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 EPDR1Q9UM22 224 aa8.93□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 PEA15Q15121 130 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 C11orf52Q96A22 123 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 TCEAL7Q9BRU2 100 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 TMEM208Q9BTX3 173 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 DIRC3C9JPN6 131 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 F6UZH7 168 aa8.91□□□□□ -0.98
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PRAME-212ENST00000485532 PDE6DO43924 150 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 TCRAP04437 139 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 AZU1P20160 251 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 CSN1S1P47710 185 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 NDUFA5Q16718 116 aa8.91□□□□□ -0.98
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PRAME-212ENST00000485532 ZNF738Q8NE65 137 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 CMTM2Q8TAZ6 248 aa8.91□□□□□ -0.98
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PRAME-212ENST00000485532 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 TREM1Q9NP99 234 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 RPH3ALQ9UNE2 315 aa8.91□□□□□ -0.98
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PRAME-212ENST00000485532 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 TMEM250H0YL14 139 aa8.9□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa8.9□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.9□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 HIST1H2BAQ96A08 127 aa8.9□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 ATG101Q9BSB4 218 aa8.9□□□□□ -0.98
PRAME-212ENST00000485532 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.89□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 INSP01308 110 aa8.89□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 DEFB130BP0DP73 79 aa8.89□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 DEFB130AP0DP74 79 aa8.89□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 AKR1C3P42330 323 aa8.89□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 ZNF575Q86XF7 245 aa8.89□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 OR8A1Q8NGG7 326 aa8.89□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 LINC00479Q96M42 142 aa8.89□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 VGLL1Q99990 258 aa8.89□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 DERL1Q9BUN8 251 aa8.89□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa8.88□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 TRAV34A0A0B4J273 112 aa8.88□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 IGLV2-11P01706 119 aa8.88□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 MED14OSP0DP75 135 aa8.88□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 ERCC8Q13216 396 aa8.88□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 RNF212Q495C1 297 aa8.88□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 KLF12Q9Y4X4 402 aa8.88□□□□□ -0.99
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PRAME-212ENST00000485532 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa8.87□□□□□ -0.99
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PRAME-212ENST00000485532 SFTA3P0C7M3 94 aa8.87□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 HTN1P15515 57 aa8.87□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 RPL35P42766 123 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 CEBPGP53567 150 aa8.87□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 TMEM75Q8N9X5 138 aa8.87□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 SGK494Q96LW2 274 aa8.87□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.87□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 PARLQ9H300 379 aa8.87□□□□□ -0.99
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