RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-211	ENST00000467464	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		8.24	□□□□□ -1.09
PTPRF-211	ENST00000467464	RBAKDN	A6NC62	111 aa		8.24	□□□□□ -1.09
PTPRF-211	ENST00000467464	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	8.24	□□□□□ -1.09
PTPRF-211	ENST00000467464	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	8.24	□□□□□ -1.09
PTPRF-211	ENST00000467464	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	8.24	□□□□□ -1.09
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF266	Q14584	549 aa		8.24	□□□□□ -1.09
PTPRF-211	ENST00000467464	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	8.24	□□□□□ -1.09
PTPRF-211	ENST00000467464	DIRC3	C9JPN6	131 aa		8.23	□□□□□ -1.09
PTPRF-211	ENST00000467464	SSNA1	O43805	119 aa		8.23	□□□□□ -1.09
PTPRF-211	ENST00000467464	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		8.23	□□□□□ -1.09
PTPRF-211	ENST00000467464	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		8.23	□□□□□ -1.09
PTPRF-211	ENST00000467464	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		8.23	□□□□□ -1.09
PTPRF-211	ENST00000467464	RGS13	O14921	159 aa		8.22	□□□□□ -1.09
PTPRF-211	ENST00000467464	PET100	P0DJ07	73 aa		8.22	□□□□□ -1.09
PTPRF-211	ENST00000467464	DEFA1	P59665	94 aa		8.22	□□□□□ -1.09
PTPRF-211	ENST00000467464	DEFA3	P59666	94 aa		8.22	□□□□□ -1.09
PTPRF-211	ENST00000467464	KHDC3L	Q587J8	217 aa		8.22	□□□□□ -1.09
PTPRF-211	ENST00000467464	TTC32	Q5I0X7	151 aa		8.22	□□□□□ -1.09
PTPRF-211	ENST00000467464		Q6AWC8	147 aa		8.22	□□□□□ -1.09
PTPRF-211	ENST00000467464		A0A1W2PPQ1	181 aa		8.21	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	IFNA5	P01569	189 aa		8.21	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	IGHV3-53	P01767	116 aa		8.21	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	RAB2A	P61019	212 aa		8.21	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	FHL2	Q14192	279 aa		8.21	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	MUC21	Q5SSG8	566 aa		8.21	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	TMED6	Q8WW62	240 aa		8.21	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	TVP23C	Q96ET8	276 aa		8.21	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	OTOR	Q9NRC9	128 aa		8.21	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		8.21	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		8.21	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	ALG5	Q9Y673	324 aa		8.21	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	CSN1S1	P47710	185 aa		8.2	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	TAS2R45	P59539	299 aa		8.2	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF415	Q09FC8	603 aa		8.2	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	8.2	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		8.2	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		8.2	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	C16orf90	A8MZG2	172 aa		8.19	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	PAX4	O43316	350 aa		8.19	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	8.19	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	CRYBA4	P53673	196 aa		8.19	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	KRTAP10-2	P60368	255 aa		8.19	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	TDRG1	Q3Y452	100 aa		8.19	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		8.19	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		8.19	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	PRO0255	Q9UI72	69 aa		8.19	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		8.19	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		8.18	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	PGP	A6NDG6	321 aa		8.18	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	CDK2AP2	O75956	126 aa		8.18	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	SFTA3	P0C7M3	94 aa		8.18	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	LINC00315	P59091	139 aa		8.18	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		8.18	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	8.18	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		8.18	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		8.18	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		8.18	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		8.18	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		8.18	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	RASL10A	Q92737	203 aa		8.18	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF479	Q96JC4	524 aa		8.18	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	HYLS1	Q96M11	299 aa		8.18	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	C8orf49	Q96NF6	230 aa		8.18	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	NXPH4	O95158	308 aa		8.17	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	GNG5	P63218	68 aa		8.17	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464		Q5BKY6	102 aa		8.17	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	SUN5	Q8TC36	379 aa		8.17	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	AQP10	Q96PS8	301 aa		8.17	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	SPX	Q9BT56	116 aa		8.17	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		8.17	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		8.16	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464		F6UZH7	168 aa		8.16	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	SIVA1	O15304	175 aa		8.16	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	8.16	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	STAG3L2	P0CL84	134 aa		8.16	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	STAG3L3	P0CL85	134 aa		8.16	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		8.16	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	SLA	Q13239	276 aa		8.16	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		8.16	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		8.16	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		8.16	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		8.16	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	BATF3	Q9NR55	127 aa		8.16	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		8.16	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		8.15	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464		A0A1W2PPV4	95 aa		8.15	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464		K7EQD1	137 aa		8.15	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	GNRH2	O43555	120 aa		8.15	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	PTTG1	O95997	202 aa		8.15	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	ATP6V0C	P27449	155 aa		8.15	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		8.15	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		8.15	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		8.15	□□□□□ -1.1
PTPRF-211	ENST00000467464	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		8.14	□□□□□ -1.11
PTPRF-211	ENST00000467464	GGTLC3	B5MD39	225 aa		8.14	□□□□□ -1.11
PTPRF-211	ENST00000467464	IGLV2-11	P01706	119 aa		8.14	□□□□□ -1.11
PTPRF-211	ENST00000467464	TYMS	P04818	313 aa		8.14	□□□□□ -1.11
PTPRF-211	ENST00000467464	GCHFR	P30047	84 aa		8.14	□□□□□ -1.11
PTPRF-211	ENST00000467464	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	8.14	□□□□□ -1.11
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	8.14	□□□□□ -1.11

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