RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377904.8

ASIC3-204, Transcript of acid sensing ion channel subunit 3, human

TSL 2

Gene ASIC3, Length 2,096 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ASIC3-204	ENST00000377904	NPS	P0C0P6	89 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	BMI1	P35226	326 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	C20orf173	Q96LM9	149 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904		A0A087WW49	117 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	TMEM213	A2RRL7	107 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	LGALS9	O00182	355 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	CTRL	P40313	264 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	HBB	P68871	147 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904		Q6ZSV7	163 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	APCS	P02743	223 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	ZNF138	P52744	262 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	ESM1	Q9NQ30	184 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	EDN2	P20800	178 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904		Q6AWC8	147 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	TMEM189	A5PLL7	270 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	CAMP	P49913	170 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	SLA	Q13239	276 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	TMEM160	Q9NX00	188 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	ITPR2	Q14571	2701 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	HAX1	O00165	279 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	OVOL1	O14753	267 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	LINC00614	P0C842	121 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	ZNF738	Q8NE65	137 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ASIC3-204	ENST00000377904	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	KRTDAP	P60985	99 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	SCGB2A2	Q13296	93 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	RCHY1	Q96PM5	261 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904		A0A1B0GUT8	65 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	SYNJ2BP	P57105	145 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	LINC00477	Q96M19	166 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	DCANP1	Q8TF63	244 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	KCNS1	Q96KK3	526 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	SRI	P30626	198 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	RIG	Q13278	110 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	NIT1	Q86X76	327 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	GATD1	Q8NB37	220 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904		A0A1B0GW15	77 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	AMT	P48728	403 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	ZNF575	Q86XF7	245 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	BATF	Q16520	125 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	LINC01559	Q495D7	138 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	SPATA45	Q537H7	98 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	ID1	P41134	155 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	TFPI2	P48307	235 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	AKAP9	Q99996	3911 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	C2orf70	A6NJV1	201 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	LINC01619	G3V211	115 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	C3orf79	P0CE67	100 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	IGLC6	P0CF74	106 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	IGLC3	P0DOY3	106 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	SRD5A1	P18405	259 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	ORM1	P02763	201 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	BORCS7	Q96B45	105 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		12.77	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	PMCH	P20382	165 aa		12.77	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	DEFB136	Q30KP8	78 aa		12.77	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		12.77	□□□□□ -0.36
ASIC3-204	ENST00000377904	SLURP1	P55000	103 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ASIC3-204	ENST00000377904	STPG4	Q8N801	248 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ASIC3-204	ENST00000377904	OR11H1	Q8NG94	326 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ASIC3-204	ENST00000377904	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ASIC3-204	ENST00000377904	C16orf95	Q9H693	158 aa		12.77	□□□□□ -0.37

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