RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF124Q15973 351 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 H3BUA1 57 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF114Q8NC26 417 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 CTSZQ9UBR2 303 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 WNK1Q9H4A3 2382 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 F5H768 121 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 WT1P19544 449 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 AZU1P20160 251 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 IGHV2-70P01814 119 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJC30Q96LL9 226 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 PLXNA2O75051 1894 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 IGHV2-5P01817 119 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 C10orf91Q5T1B1 145 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 IGLC7A0M8Q6 106 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 INS-IGF2F8WCM5 200 aa16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFS7O75251 213 aa16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 MYLKQ15746 1914 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 ATP6V0BQ99437 205 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 SMIM2Q9BVW6 85 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 CFHR3Q02985 330 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 IGF2-ASQ6U949 168 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 ZNRF2Q8NHG8 242 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 GAGE12BA1L429 117 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 GAGE7O76087 117 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 GAGE12FP0CL80 117 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 GAGE12GP0CL81 117 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 GAGE12IP0CL82 117 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 F8WEM9 126 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM243Q9BU79 118 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 FAM120AOSQ5T036 256 aa16.02■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA1671Q9BY89 1806 aa16.02■□□□□ 0.16
CCSAP-203ENST00000366687 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 OR11H6Q8NGC7 330 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 LGALS9BQ3B8N2 356 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 LGALS9CQ6DKI2 356 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 GRNP28799 593 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 ZFAND6Q6FIF0 208 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 LHBP01229 141 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 OCIAD2Q56VL3 154 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 PYGO2Q9BRQ0 406 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 KLF12Q9Y4X4 402 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 C9JAW5 83 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 APOC4P55056 127 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 DKK4Q9UBT3 224 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 NPYP01303 97 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 IGLC2P0DOY2 106 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 IGLC3P0DOY3 106 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 Q6ZSR3 168 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 COX11Q9Y6N1 276 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 VWC2Q2TAL6 325 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 LENEPQ9Y5L5 61 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 VPREB3Q9UKI3 123 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 HLA-DRB4P13762 266 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 C20orf78Q9BR46 151 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 Q6ZWC4 215 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 TNCP24821 2201 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 F8VRH5 84 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 LTAP01374 205 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 DEFB112Q30KQ8 113 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 VWC2LB2RUY7 222 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 EREGO14944 169 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 TANC1Q9C0D5 1861 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 IGHV4-59P01825 116 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 FOXI2Q6ZQN5 318 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFA12Q9UI09 145 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 LYPD6BQ8NI32 183 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-203ENST00000366687 DYSFO75923 2080 aa15.96■□□□□ 0.14
CCSAP-203ENST00000366687 PFN2P35080 140 aa15.96■□□□□ 0.14
CCSAP-203ENST00000366687 PTPN13Q12923 2485 aa15.95■□□□□ 0.14
CCSAP-203ENST00000366687 C17orf77Q96MU5 243 aa15.95■□□□□ 0.14
CCSAP-203ENST00000366687 IGLL1P15814 213 aa15.95■□□□□ 0.14
CCSAP-203ENST00000366687 GAGE6Q13070 117 aa15.95■□□□□ 0.14
CCSAP-203ENST00000366687 COX8AP10176 69 aa15.94■□□□□ 0.14
CCSAP-203ENST00000366687 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa15.94■□□□□ 0.14
CCSAP-203ENST00000366687 TCF15Q12870 199 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.6 ms