RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 TEX22C9J3V5 150 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 H3BVH4 76 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 LGALS9O00182 355 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 SERF2P84101 59 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 ELOBQ15370 118 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 WDR73Q6P4I2 378 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 WFDC9Q8NEX5 89 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 MUC4Q99102 2169 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 C7orf71A4D174 169 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 H0Y8G0 127 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 IGLV1-40P01703 118 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 GCSAMLQ5JQS6 135 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 Q6ZWC4 215 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 KIR2DL5AQ8N109 375 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 PSG8Q9UQ74 426 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 IGKV1-17P01599 117 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 APOHP02749 345 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 SFTA3P0C7M3 94 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 P0C879 139 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 GYPEP15421 78 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 GCHFRP30047 84 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 FHL3Q13643 280 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 NEGR1Q7Z3B1 354 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 Q8N6K4 173 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 TOMM7Q9P0U1 55 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 KRBOX1C9JBD0 128 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 WIPF1O43516 503 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 RPL29P47914 159 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 PYGO2Q9BRQ0 406 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 OTORQ9NRC9 128 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 CELSR2Q9HCU4 2923 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 AGRNO00468 2067 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 I3L2K1 104 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 MT-ND4LP03901 98 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 IFITM2Q01629 132 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 AARDQ4LEZ3 155 aa3.34□□□□□ -1.88
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PTPRC-201ENST00000348564 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 Q6ZN92 141 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM18Q96B42 140 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 WFDC1Q9HC57 220 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 WDR83OSQ9Y284 106 aa3.34□□□□□ -1.88
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PTPRC-201ENST00000348564 C16orf54Q6UWD8 224 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRC-201ENST00000348564 A0A087WWL8 130 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 GGTLC3B5MD39 225 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 BUB3O43684 328 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 TAS2R60P59551 318 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRC-201ENST00000348564 CYTL1Q9NRR1 136 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 SMIM9A6NGZ8 99 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 A8MWL6 223 aa3.32□□□□□ -1.88
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PTPRC-201ENST00000348564 BTN1A1Q13410 526 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 Q6ZTC4 211 aa3.32□□□□□ -1.88
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PTPRC-201ENST00000348564 C1orf134Q5TEV5 83 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 Q8N2B8 174 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa3.32□□□□□ -1.88
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PTPRC-201ENST00000348564 K7EQG2 157 aa3.32□□□□□ -1.88
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PTPRC-201ENST00000348564 CRYGBP07316 175 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 CLPSL2Q6UWE3 100 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 C11orf1Q9H5F2 150 aa3.32□□□□□ -1.88
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