RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628545.1

GLIS1-202, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-202ENST00000628545 OR10J6PQ8NGY7 276 aa13.84□□□□□ -0.19
GLIS1-202ENST00000628545 C8orf49Q96NF6 230 aa13.84□□□□□ -0.19
GLIS1-202ENST00000628545 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa13.83□□□□□ -0.19
GLIS1-202ENST00000628545 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.19
GLIS1-202ENST00000628545 GAS8-AS1O95177 125 aa13.83□□□□□ -0.19
GLIS1-202ENST00000628545 LINC00694P0DN24 101 aa13.83□□□□□ -0.19
GLIS1-202ENST00000628545 INS-IGF2F8WCM5 200 aa13.83□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 HES7Q9BYE0 225 aa13.83□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 TRGV9Q99603 122 aa13.82□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 GPR179Q6PRD1 2367 aa13.82□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 SRRM5B3KS81 715 aa13.82□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 GLRXP35754 106 aa13.82□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 HIGD1AQ9Y241 93 aa13.82□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa13.82□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 PATE3B3GLJ2 98 aa13.82□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 LPAL2Q16609 132 aa13.82□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 LYZP61626 148 aa13.81□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 PRR14LQ5THK1 2151 aa13.81□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 LYZL6O75951 148 aa13.81□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 HCP5Q6MZN7 132 aa13.81□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 C17orf77Q96MU5 243 aa13.81□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 RAXQ9Y2V3 346 aa13.81□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 A0A1W2PPI3 338 aa13.8□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 LINC01546A6NGU7 62 aa13.8□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 NDUFA3O95167 84 aa13.8□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 CFIP05156 583 aa13.8□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 LYRM7Q5U5X0 104 aa13.8□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 UBE2D1P51668 147 aa13.79□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 ODF3Q96PU9 254 aa13.79□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 C21orf62Q9NYP8 219 aa13.79□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 PROCRQ9UNN8 238 aa13.79□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 PLXNB1O43157 2135 aa13.79□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 DSCAML1Q8TD84 2053 aa13.79□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 SCGB1C2P0DMR2 95 aa13.79□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa13.78□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 CCL4P13236 92 aa13.78□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 RPL7P18124 248 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 IL11RAQ14626 422 aa13.78□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 LINC01559Q495D7 138 aa13.78□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 TMEM14CQ9P0S9 112 aa13.78□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 U3KQA8 63 aa13.78□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 SH2D1AO60880 128 aa13.78□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 C15orf53Q8NAA6 179 aa13.78□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa13.78□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 RNF185Q96GF1 192 aa13.78□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 TNFRSF6BO95407 300 aa13.77□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 TGFAP01135 160 aa13.77□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 CACNA1HO95180 2353 aa13.77□□□□□ -0.2
GLIS1-202ENST00000628545 FAM201AQ5SY85 155 aa13.77□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 SAP25Q8TEE9 199 aa13.77□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 CHCHD5Q9BSY4 110 aa13.77□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 MSRB1Q9NZV6 116 aa13.77□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 TRBV19A0A075B6N1 114 aa13.77□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 M0R3E3 92 aa13.77□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 IGHV1-2P23083 117 aa13.77□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 TTTY12Q9BZ98 90 aa13.77□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 APELAP0DMC3 54 aa13.76□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 OR11H6Q8NGC7 330 aa13.76□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 SIGLEC9Q9Y336 463 aa13.76□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa13.76□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 DSCAMO60469 2012 aa13.75□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 ABCA1O95477 2261 aa13.75□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 SLC25A20O43772 301 aa13.75□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 MYOZ3Q8TDC0 251 aa13.75□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF318Q5VUA4 2279 aa13.75□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 PLNP26678 52 aa13.74□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 CCL11P51671 97 aa13.74□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 LY6DQ14210 128 aa13.74□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 UBTD1Q9HAC8 227 aa13.74□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa13.74□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 AAMDCQ9H7C9 122 aa13.74□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 NGBQ9NPG2 151 aa13.74□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 TPSG1Q9NRR2 321 aa13.74□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 CD7P09564 240 aa13.72□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 Q8N1Y9 231 aa13.72□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa13.72□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 URB1O60287 2271 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 Q8N8P6 123 aa13.72□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 FAM57AQ8TBR7 257 aa13.72□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 MZT1Q08AG7 82 aa13.72□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 OR4C13Q8NGP0 309 aa13.72□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 BAALCQ8WXS3 180 aa13.71□□□□□ -0.21
GLIS1-202ENST00000628545 C9JAW5 83 aa13.71□□□□□ -0.22
GLIS1-202ENST00000628545 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP13.71□□□□□ -0.22
GLIS1-202ENST00000628545 NDUFA11Q86Y39 141 aa13.71□□□□□ -0.22
GLIS1-202ENST00000628545 SCNM1Q9BWG6 230 aa13.71□□□□□ -0.22
GLIS1-202ENST00000628545 EFNA4P52798 201 aa13.7□□□□□ -0.22
GLIS1-202ENST00000628545 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms