RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	OR51H1	Q8NH63	302 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB24	Q969Q5	203 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	PYURF	Q96I23	114 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440		M0R2P5	195 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	FGF6	P10767	208 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB5C	P51148	216 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	BAK1	Q16611	211 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	ACY3	Q96HD9	319 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	C4orf36	Q96KX1	117 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	GID8	Q9NWU2	228 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	CMTM6	Q9NX76	183 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A0A6YYD4	124 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A0G2JRQ6	117 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	KLLN	B2CW77	178 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440		P01737	135 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	UBB	P0CG47	229 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	CRISP2	P16562	243 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	HACD4	Q5VWC8	232 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	TVP23C	Q96ET8	276 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNK15	Q9H427	330 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440		M0R129	80 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF253	O75346	499 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	PKIA	P61925	76 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	P2RY14	Q15391	338 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	COQ5	Q5HYK3	327 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	FEV	Q99581	238 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	DAPL1	A0PJW8	107 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	GPX1	P07203	203 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4E1	P0C645	316 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	ARPC4	P59998	168 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP10-5	P60370	271 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	REG3A	Q06141	175 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	ZFP92	A6NM28	416 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR31	O00270	319 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC17A3	O00476	420 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	FABP1	P07148	127 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	HTR2B	P41595	481 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	MSMO1	Q15800	293 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	UFD1	Q92890	307 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	ENY2	Q9NPA8	101 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	C9orf92	A6NGG3	77 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	CTXN2	P0C2S0	81 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	S100A7	P31151	101 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	LPAR6	P43657	344 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	GNG11	P61952	73 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	CIB1	Q99828	191 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A087X0K7	114 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440		G3V2T6	193 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	NME4	O00746	187 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	CTDSPL	O15194	276 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	BCL2	P10415	239 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM50B	P56557	158 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNAP23-223	ENST00000627440	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		3.06	□□□□□ -1.92

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