RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621217.4

GGA3-222, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 4,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-222ENST00000621217 IGKCP01834 107 aa7.29□□□□□ -1.24
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GGA3-222ENST00000621217 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa7.28□□□□□ -1.24
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GGA3-222ENST00000621217 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa7.27□□□□□ -1.25
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GGA3-222ENST00000621217 IGKV3-20P01619 116 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 GAGE12FP0CL80 117 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 GAGE12GP0CL81 117 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 GAGE12IP0CL82 117 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 RPL15P61313 204 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 GAGE4Q13068 117 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 MFAP4P55083 255 aa7.25□□□□□ -1.25
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GGA3-222ENST00000621217 ZNF815PA8K554 130 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 B5MCH6 92 aa7.24□□□□□ -1.25
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GGA3-222ENST00000621217 TEX45Q8NA69 505 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 COPS9Q8WXC6 57 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 KIR2DL4Q99706 377 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.24□□□□□ -1.25
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GGA3-222ENST00000621217 TOMM40O96008 361 aa7.23□□□□□ -1.25
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