RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566833.1

CCNDBP1-209, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-209ENST00000566833 SPRY2O43597 315 aa9.88□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 PAGE4O60829 102 aa9.88□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 LEPP41159 167 aa9.88□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 SPINK13Q1W4C9 94 aa9.88□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 TEX261Q6UWH6 196 aa9.88□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 AMTNQ6UX39 209 aa9.88□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 RETNQ9HD89 108 aa9.88□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 EPDR1Q9UM22 224 aa9.88□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 F6UZH7 168 aa9.87□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 M0R2Z0 102 aa9.87□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 CDKN1BP46527 198 aa9.87□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZNF138P52744 262 aa9.87□□□□□ -0.83
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CCNDBP1-209ENST00000566833 RNF183Q96D59 192 aa9.87□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 VGLL1Q99990 258 aa9.87□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa9.87□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa9.87□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 J3KRW8 73 aa9.86□□□□□ -0.83
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CCNDBP1-209ENST00000566833 TCRAP04437 139 aa9.86□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 CT45A10P0DMU9 189 aa9.86□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 CCL20P78556 96 aa9.86□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa9.86□□□□□ -0.83
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CCNDBP1-209ENST00000566833 ODF3Q96PU9 254 aa9.86□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 ATG101Q9BSB4 218 aa9.86□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 TMEM208Q9BTX3 173 aa9.86□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa9.86□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 C11orf94C9JXX5 98 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 PEX7O00628 323 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 ATP5G3P48201 142 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 Q8TAT8 98 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 HIST1H2BAQ96A08 127 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 RARRES2Q99969 163 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 OVOL2Q9BRP0 275 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 TCEAL7Q9BRU2 100 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 NDFIP1Q9BT67 221 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZNF492Q9P255 531 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 OR11H2Q8NH07 326 aa9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 SGK494Q96LW2 274 aa9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 TXNDC17Q9BRA2 123 aa9.84□□□□□ -0.83
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CCNDBP1-209ENST00000566833 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-209ENST00000566833 GPX1P07203 203 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-209ENST00000566833 BCL2P10415 239 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-209ENST00000566833 AKR1C3P42330 323 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-209ENST00000566833 UBE2G1P62253 170 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-209ENST00000566833 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-209ENST00000566833 TMEM75Q8N9X5 138 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-209ENST00000566833 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-209ENST00000566833 PSG8Q9UQ74 426 aa9.83□□□□□ -0.84
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CCNDBP1-209ENST00000566833 RAB14P61106 215 aa9.82□□□□□ -0.84
CCNDBP1-209ENST00000566833 PMS2P11Q13670 270 aa9.82□□□□□ -0.84
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CCNDBP1-209ENST00000566833 PRNTQ86SH4 94 aa9.82□□□□□ -0.84
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CCNDBP1-209ENST00000566833 TRAV34A0A0B4J273 112 aa9.81□□□□□ -0.84
CCNDBP1-209ENST00000566833 C7orf71A4D174 169 aa9.81□□□□□ -0.84
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CCNDBP1-209ENST00000566833 CRISP2P16562 243 aa9.81□□□□□ -0.84
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CCNDBP1-209ENST00000566833 TREM1Q9NP99 234 aa9.81□□□□□ -0.84
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CCNDBP1-209ENST00000566833 KLLNB2CW77 178 aa9.8□□□□□ -0.84
CCNDBP1-209ENST00000566833 PDE6DO43924 150 aa9.8□□□□□ -0.84
CCNDBP1-209ENST00000566833 MIFP14174 115 aa9.8□□□□□ -0.84
CCNDBP1-209ENST00000566833 BTN1A1Q13410 526 aa9.8□□□□□ -0.84
CCNDBP1-209ENST00000566833 KIR3DS1Q14943 382 aa9.8□□□□□ -0.84
CCNDBP1-209ENST00000566833 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa9.8□□□□□ -0.84
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZNF767PQ75MW2 155 aa9.8□□□□□ -0.84
CCNDBP1-209ENST00000566833 C1orf158Q8N1D5 194 aa9.8□□□□□ -0.84
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa9.8□□□□□ -0.84
CCNDBP1-209ENST00000566833 LYPD6BQ8NI32 183 aa9.8□□□□□ -0.84
CCNDBP1-209ENST00000566833 FMC1Q96HJ9 113 aa9.8□□□□□ -0.84
CCNDBP1-209ENST00000566833 LINC00479Q96M42 142 aa9.8□□□□□ -0.84
CCNDBP1-209ENST00000566833 RBFOX3A6NFN3 312 aa9.79□□□□□ -0.84
CCNDBP1-209ENST00000566833 SMIM9A6NGZ8 99 aa9.79□□□□□ -0.84
CCNDBP1-209ENST00000566833 H7BYZ3 331 aa9.79□□□□□ -0.84
CCNDBP1-209ENST00000566833 S100A9P06702 114 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
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