RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 PAGE4O60829 102 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF253O75346 499 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 IGLC2P0DOY2 106 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 MEOX2P50222 304 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 Q8N1X5 172 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 CA1P00915 261 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 HLA-DMBP28068 263 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 METTL26Q96S19 204 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 HSPG2P98160 4391 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 HERC1Q15751 4861 aa6.76□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 A0A087X0K7 114 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 GGTLC3B5MD39 225 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 PYYP10082 97 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 NPPCP23582 126 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 Q6ZTC4 211 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.75□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.74□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.74□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 OR10J4P0C629 311 aa6.74□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 ATP5G3P48201 142 aa6.74□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.74□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 CST9LP1Q5W188 147 aa6.74□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 LEMD1Q68G75 181 aa6.74□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.74□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.74□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 OTORQ9NRC9 128 aa6.74□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.74□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 PRELID1Q9Y255 219 aa6.74□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.74□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 PKD1P98161 4303 aa6.74□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.74□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 A0A1W2PS18 150 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 B4DEV8 164 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 C9JCJ5 164 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 H3BQ15 152 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 NDUFB4O95168 129 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 AMBPP02760 352 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 UBE2G2P60604 165 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 GLMPQ8WWB7 406 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 PARLQ9H300 379 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF727A8MUV8 499 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 S100A9P06702 114 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 MIFP14174 115 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 GALR1P47211 349 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 TFPI2P48307 235 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 TAS2R60P59551 318 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 PSG9Q00887 426 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 RHEBQ15382 184 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF124Q15973 351 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 SMIM12Q96EX1 92 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 GRAMD2BQ96HH9 432 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 Q9H3A6 140 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 NAT8Q9UHE5 227 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 EPDR1Q9UM22 224 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 KLF12Q9Y4X4 402 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 A0A087WWC5 75 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 HELTA6NFD8 242 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 RANP62826 216 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
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