RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	FXYD5	Q96DB9	178 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	GPR82	Q96P67	336 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	OR51M1	Q9H341	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	RPRM	Q9NS64	109 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	MUC4	Q99102	2169 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688		A0A0D9SG52	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	ISLR	O14498	428 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	TAAR5	O14804	337 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	NDUFB4	O95168	129 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	HBE1	P02100	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	MEOX2	P50222	304 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	EMP1	P54849	157 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	UBE2G2	P60604	165 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	GNG5	P63218	68 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	ERCC8	Q13216	396 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	ICAM4	Q14773	271 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	KHDC3L	Q587J8	217 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	LCN15	Q6UWW0	184 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	S100A7A	Q86SG5	101 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688		Q8N1X5	172 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	RNF141	Q8WVD5	230 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	HYLS1	Q96M11	299 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	KMT2A	Q03164	3969 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	HERC2	O95714	4834 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688		A0A0J9YX75	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688		M0R2Z0	102 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	TAS2R45	P59539	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	PSG3	Q16557	428 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	BAP18	Q8IXM2	172 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	C6orf223	Q8N319	242 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688		Q8TAT8	98 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	ATG101	Q9BSB4	218 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688		Q9H3A6	140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	PRM2	P04554	102 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	STAG3L2	P0CL84	134 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	STAG3L3	P0CL85	134 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	HTN3	P15516	51 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	GCHFR	P30047	84 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	DAD1	P61803	113 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	KIR3DS1	Q14943	382 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	RRN3P1	Q2M238	152 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	SGK494	Q96LW2	274 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CS-233	ENST00000552688	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CS-233	ENST00000552688	PGP	A6NDG6	321 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CS-233	ENST00000552688	MB	P02144	154 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CS-233	ENST00000552688	CCL18	P55774	89 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CS-233	ENST00000552688	SERF2	P84101	59 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CS-233	ENST00000552688	PSG9	Q00887	426 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CS-233	ENST00000552688	GUK1	Q16774	197 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CS-233	ENST00000552688	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CS-233	ENST00000552688	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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