RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-221ENST00000550734 MIR17HGQ75NE6 70 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-221ENST00000550734 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-221ENST00000550734 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-221ENST00000550734 FUT9Q9Y231 359 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-221ENST00000550734 TIMM9Q9Y5J7 89 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-221ENST00000550734 KLLNB2CW77 178 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-221ENST00000550734 ATP5G1P05496 136 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-221ENST00000550734 CRISP2P16562 243 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-221ENST00000550734 RPL12P30050 165 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-221ENST00000550734 ATP5G3P48201 142 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-221ENST00000550734 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-221ENST00000550734 TMEM88Q6PEY1 159 aa8.09□□□□□ -1.11
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CS-221ENST00000550734 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-221ENST00000550734 FXYD5Q96DB9 178 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-221ENST00000550734 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-221ENST00000550734 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-221ENST00000550734 OR51M1Q9H341 326 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-221ENST00000550734 AAMDCQ9H7C9 122 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-221ENST00000550734 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 PTTG1O95997 202 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 DEFB130BP0DP73 79 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 DEFB130AP0DP74 79 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 HTN3P15516 51 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 FCN2Q15485 313 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 CCDC28AQ8IWP9 274 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 MBD2Q9UBB5 411 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 C16orf90A8MZG2 172 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 IFNA5P01569 189 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 HTN1P15515 57 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 ICAM4Q14773 271 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 RGS21Q2M5E4 152 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 Q8N1X5 172 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 BLNKQ8WV28 456 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 RNF141Q8WVD5 230 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 ZNF503Q96F45 646 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 PAXXQ9BUH6 204 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 C7orf71A4D174 169 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 RBAKDNA6NC62 111 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 SCGB1C1Q8TD33 95 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 C18orf15Q96N68 181 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 WFDC1Q9HC57 220 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 ZNF492Q9P255 531 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 ALG5Q9Y673 324 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 TAS2R45P59539 299 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 TNP2Q05952 138 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 ERCC8Q13216 396 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 KHDC3LQ587J8 217 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa8.05□□□□□ -1.12
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CS-221ENST00000550734 ASB13Q8WXK3 278 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 SNURFLB1AK76 121 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 F5H768 121 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 H3BNG1 76 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 OR7C2O60412 319 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 GPX1P07203 203 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 OR10J4P0C629 311 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 M6PRP20645 277 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 ZNF138P52744 262 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 CD300CQ08708 224 aa8.04□□□□□ -1.12
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CS-221ENST00000550734 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 ZNF680Q8NEM1 530 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 PHYHIPLQ96FC7 376 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 VGLL1Q99990 258 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 SMIM3Q9BZL3 60 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 J3KRW8 73 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 CSN1S1P47710 185 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 RANP62826 216 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 OR2G3Q8NGZ4 309 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 RXFP4Q8TDU9 374 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 TMED6Q8WW62 240 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 AQP10Q96PS8 301 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 MED28Q9H204 178 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-221ENST00000550734 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CS-221ENST00000550734 TCL1AP56279 114 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-221ENST00000550734 BTN1A1Q13410 526 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-221ENST00000550734 ZNF266Q14584 549 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-221ENST00000550734 PRR9Q5T870 116 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-221ENST00000550734 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CS-221ENST00000550734 Q9H3A6 140 aa8.02□□□□□ -1.13
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