RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 CST7O76096 145 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 CA1P00915 261 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 CTSGP08311 255 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 SERF2P84101 59 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 CASC10Q5T4H9 136 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 SCGB1C1Q8TD33 95 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 TXN2Q99757 166 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 PARLQ9H300 379 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 H0Y980 276 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 K7EIM0 57 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 SPATA45Q537H7 98 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 OCIAD2Q56VL3 154 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 Q6ZN92 141 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 ZNF709Q8N972 641 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 Q8N976 141 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 RPH3ALQ9UNE2 315 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 STARD9Q9P2P6 4700 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 HYPMO75409 117 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 KIR2DS2P43631 304 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 PSMB3P49720 205 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 FAM78BQ5VT40 261 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 LCN12Q6JVE5 192 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 TMEM222Q9H0R3 208 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 CST9LQ9H4G1 147 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 ZNF586Q9NXT0 402 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa5.62□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 NBEAP1P0C6P0 100 aa5.62□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 LINC00310P59036 64 aa5.62□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 Q0VG73 95 aa5.62□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa5.62□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 DIRC3C9JPN6 131 aa5.62□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 TMEM50AO95807 157 aa5.62□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 HLA-DMBP28068 263 aa5.62□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 BMI1P35226 326 aa5.62□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 PAX9P55771 341 aa5.62□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 RNF182Q8N6D2 247 aa5.62□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa5.62□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 C8orf31Q8N9H6 132 aa5.62□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 K7ERU9 68 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 MFAP4P55083 255 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 NMSQ5H8A3 153 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 OR8I2Q8N0Y5 310 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 TTC9CQ8N5M4 171 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 OR1B1Q8NGR6 318 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 OR11H2Q8NH07 326 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 USMG5Q96IX5 58 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 SERF1AO75920 110 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 CRISP2P16562 243 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 GDF5OSQ5U4N7 250 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 TMEM116Q8NCL8 245 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 RAB40CQ96S21 281 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 RSG1Q9BU20 258 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 SAMD10Q9BYL1 202 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 VSIRQ9H7M9 311 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 SLC39A9Q9NUM3 307 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 TIMM9Q9Y5J7 89 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 FRAS1Q86XX4 4008 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 C15orf61A6NNL5 157 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 NPPCP23582 126 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 TSPOP30536 169 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 ODF3L2Q3SX64 289 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 C16orf54Q6UWD8 224 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 ZNF502Q8TBZ5 544 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 SPRY2O43597 315 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 DEFB130BP0DP73 79 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 DEFB130AP0DP74 79 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.6□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 VAMP3Q15836 100 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 SGK494Q96LW2 274 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 PRNDQ9UKY0 176 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 M0R2Z0 102 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 ZNF253O75346 499 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 SLC25A6P12236 298 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 STHQ8IWL8 128 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 GRIFINA4D1Z8 144 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 GPX1P07203 203 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 PSG1P11464 419 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 KRTDAPP60985 99 aa5.59□□□□□ -1.51
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