RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.46□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H3BQ15 152 aa6.46□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 M0R3E3 92 aa6.46□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.46□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.46□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.46□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RASL10AQ92737 203 aa6.46□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.46□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.46□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VCXQ9H320 206 aa6.46□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.46□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.46□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.45□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa6.45□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRSS46E5RG02 174 aa6.45□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AKR1C4P17516 323 aa6.45□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TGFBR1P36897 503 aa6.45□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C14orf177Q52M58 125 aa6.45□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.45□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBE2WQ96B02 151 aa6.45□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLK12Q9UKR0 248 aa6.45□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H3BP45 60 aa6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WRBO00258 174 aa6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AQP4P55087 323 aa6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPANXN5Q5MJ07 72 aa6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAAP20Q6NZ36 180 aa6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 S100A7AQ86SG5 101 aa6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR10J4P0C629 311 aa6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHTF8P0CG12 524 aa6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGLC2P0DOY2 106 aa6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLP1P60201 277 aa6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 REG3GQ6UW15 175 aa6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GTSF1Q8WW33 167 aa6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C2orf50Q96LR7 162 aa6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SRRQ9GZT4 340 aa6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A087WYN8 130 aa6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 USP17L23D6RBM5 183 aa6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRSS1P07477 247 aa6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPP30P78346 268 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C7orf33Q8WU49 177 aa6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAB2BQ8WUD1 216 aa6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CNBD2Q96M20 576 aa6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPXQ9BT56 116 aa6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NAGKQ9UJ70 344 aa6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A0B4J2A0 478 aa6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C5orf51A6NDU8 294 aa6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAB3DO95716 219 aa6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HLA-DQA1P01909 254 aa6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CRISP2P16562 243 aa6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SELENOTP62341 195 aa6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RHOHQ15669 191 aa6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BAK1Q16611 211 aa6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR52I2Q8NH67 350 aa6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR51M1Q9H341 326 aa6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BLOC1S6Q9UL45 172 aa6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNF24Q9Y225 148 aa6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GAGE12JA6NER3 117 aa6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COX7A2P2O60397 106 aa6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF253O75346 499 aa6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GAGE1Q13065 139 aa6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GAGE4Q13068 117 aa6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GAGE5Q13069 117 aa6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GAGE13Q4V321 117 aa6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q8TAT8 98 aa6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKRD65E5RJM6 399 aa6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 M0R2P5 195 aa6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GOSR2O14653 212 aa6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AGPAT2O15120 278 aa6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GNRH2O43555 120 aa6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAB31Q13636 194 aa6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRR4Q16378 134 aa6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NIT1Q86X76 327 aa6.39□□□□□ -1.39
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