RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533628.5

RPUSD4-208, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPUSD4, Length 2,053 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4-208ENST00000533628 ESDP10768 282 aa9.57□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 CTRLP40313 264 aa9.57□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 PLP1P60201 277 aa9.57□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 DYNLRB2Q8TF09 96 aa9.57□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 METTL26Q96S19 204 aa9.57□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 ATP5SQ99766 215 aa9.57□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 GGTLC1Q9BX51 225 aa9.57□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 GNG13Q9P2W3 67 aa9.57□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 UQCR10Q9UDW1 63 aa9.57□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 RFNGQ9Y644 331 aa9.57□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa9.57□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa9.57□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 MPDU1O75352 247 aa9.57□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 TMEM61Q8N0U2 210 aa9.57□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 TMEM256Q8N2U0 113 aa9.57□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 CMTM2Q8TAZ6 248 aa9.57□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 CST9LQ9H4G1 147 aa9.57□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 NOTCH1P46531 2555 aa9.56□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 LYZP61626 148 aa9.56□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 PRR20EP86478 221 aa9.56□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 PRR20CP86479 221 aa9.56□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 PRR20DP86480 221 aa9.56□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 PRR20BP86481 221 aa9.56□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 PRR20AP86496 221 aa9.56□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 RAB31Q13636 194 aa9.56□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 BTF3L4Q96K17 158 aa9.56□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 RABAC1Q9UI14 185 aa9.56□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 TRAV25A0A0B4J276 109 aa9.55□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa9.55□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 A6NJY4 79 aa9.55□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 BUB3O43684 328 aa9.55□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 IFNA5P01569 189 aa9.55□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 ADIRFQ15847 76 aa9.55□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 ANAPC16Q96DE5 110 aa9.55□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 NUPR1O60356 82 aa9.55□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 S100A7P31151 101 aa9.55□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 LCN12Q6JVE5 192 aa9.55□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 PATE2Q6UY27 113 aa9.55□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 GLMPQ8WWB7 406 aa9.55□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 A0A1W2PS18 150 aa9.54□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 GP9P14770 177 aa9.54□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 CST9LP1Q5W188 147 aa9.54□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 MIC13Q5XKP0 118 aa9.54□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 SCGB1C1Q8TD33 95 aa9.54□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 SMIM7Q9BQ49 75 aa9.54□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 NPCDR1Q9BY65 106 aa9.54□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 PXMP4Q9Y6I8 212 aa9.54□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 ORM2P19652 201 aa9.54□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 RPL23P62829 140 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 KCNIP4Q6PIL6 250 aa9.54□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 TCF24Q7RTU0 167 aa9.54□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 OR1B1Q8NGR6 318 aa9.54□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 PRR25Q96S07 402 aa9.54□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 KCNIP2Q9NS61 270 aa9.54□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 FBN3Q75N90 2809 aa9.53□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 K7ERU9 68 aa9.53□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 HYPMO75409 117 aa9.53□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 IGLC2P0DOY2 106 aa9.53□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 IGLC3P0DOY3 106 aa9.53□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 TMEM41BQ5BJD5 291 aa9.53□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 MBD3L1Q8WWY6 194 aa9.53□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 MANBALQ9NQG1 85 aa9.53□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 C17orf112F2Z3M2 114 aa9.52□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 IFNA1P01562 189 aa9.52□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 Q6ZN92 141 aa9.52□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 Q8N1Y9 231 aa9.52□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 SLC39A9Q9NUM3 307 aa9.52□□□□□ -0.88
RPUSD4-208ENST00000533628 SORL1Q92673 2214 aa9.52□□□□□ -0.89
RPUSD4-208ENST00000533628 H3BRN7 92 aa9.52□□□□□ -0.89
RPUSD4-208ENST00000533628 K7EIL1 84 aa9.52□□□□□ -0.89
RPUSD4-208ENST00000533628 CFAP161Q6P656 301 aa9.52□□□□□ -0.89
RPUSD4-208ENST00000533628 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF709Q8N972 641 aa9.52□□□□□ -0.89
RPUSD4-208ENST00000533628 GRAMD2BQ96HH9 432 aa9.52□□□□□ -0.89
RPUSD4-208ENST00000533628 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
RPUSD4-208ENST00000533628 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa9.52□□□□□ -0.89
RPUSD4-208ENST00000533628 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
RPUSD4-208ENST00000533628 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa9.52□□□□□ -0.89
RPUSD4-208ENST00000533628 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa9.51□□□□□ -0.89
RPUSD4-208ENST00000533628 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RPUSD4-208ENST00000533628 SPATA45Q537H7 98 aa9.51□□□□□ -0.89
RPUSD4-208ENST00000533628 Q8N976 141 aa9.51□□□□□ -0.89
RPUSD4-208ENST00000533628 CLUHP3Q96NS8 147 aa9.51□□□□□ -0.89
RPUSD4-208ENST00000533628 UHRF2Q96PU4 802 aa9.51□□□□□ -0.89
RPUSD4-208ENST00000533628 RSG1Q9BU20 258 aa9.51□□□□□ -0.89
RPUSD4-208ENST00000533628 HIGD1AQ9Y241 93 aa9.51□□□□□ -0.89
RPUSD4-208ENST00000533628 TIMM9Q9Y5J7 89 aa9.51□□□□□ -0.89
RPUSD4-208ENST00000533628 TMEM250H0YL14 139 aa9.51□□□□□ -0.89
RPUSD4-208ENST00000533628 LINC00310P59036 64 aa9.51□□□□□ -0.89
RPUSD4-208ENST00000533628 C17orf77Q96MU5 243 aa9.51□□□□□ -0.89
RPUSD4-208ENST00000533628 C19orf73Q9NVV2 129 aa9.51□□□□□ -0.89
RPUSD4-208ENST00000533628 CD7P09564 240 aa9.5□□□□□ -0.89
RPUSD4-208ENST00000533628 MORN5Q5VZ52 161 aa9.5□□□□□ -0.89
RPUSD4-208ENST00000533628 S100A7AQ86SG5 101 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.2 ms