RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513284.5

RNF4-218, Transcript of ring finger protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene RNF4, Length 517 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF4-218ENST00000513284 PRELID1Q9Y255 219 aa7.55□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.54□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 NXPH4O95158 308 aa7.54□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 IGLC2P0DOY2 106 aa7.54□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 HBG1P69891 147 aa7.54□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 HBG2P69892 147 aa7.54□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 ARL16Q0P5N6 197 aa7.54□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 KIR3DS1Q14943 382 aa7.54□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 OPCMLQ14982 345 aa7.54□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 NRARPQ7Z6K4 114 aa7.54□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 MGST2Q99735 147 aa7.54□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 NUDT15Q9NV35 164 aa7.54□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 UQCC1Q9NVA1 299 aa7.54□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.53□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.53□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.53□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 C5orf51A6NDU8 294 aa7.53□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 A6NHS1 94 aa7.53□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 FAM25EA8MYX2 175 aa7.53□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 J3KRW8 73 aa7.53□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 CCSO14618 274 aa7.53□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 BAXQ07812 192 aa7.53□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 NFE4Q86UQ8 179 aa7.53□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 STX12Q86Y82 276 aa7.53□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 TMEM37Q8WXS4 190 aa7.53□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 SEC22CQ9BRL7 303 aa7.53□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 C11orf1Q9H5F2 150 aa7.53□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 AAMDCQ9H7C9 122 aa7.53□□□□□ -1.2
RNF4-218ENST00000513284 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.52□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa7.52□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 NPIPB6E9PJ23 425 aa7.52□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 H3BTX0 84 aa7.52□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 SLC17A3O00476 420 aa7.52□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 OXTP01178 125 aa7.52□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.52□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 S100A11P31949 105 aa7.52□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 RPL29P47914 159 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 IL15RAQ13261 267 aa7.52□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 PDE6HQ13956 83 aa7.52□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 ATP6V1FQ16864 119 aa7.52□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 MIC13Q5XKP0 118 aa7.52□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.52□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 LINC00477Q96M19 166 aa7.52□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa7.52□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 WDR83OSQ9Y284 106 aa7.52□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 TIMM9Q9Y5J7 89 aa7.52□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 C7orf71A4D174 169 aa7.51□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 PRAC2D3DTV9 90 aa7.51□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 H3BQ15 152 aa7.51□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 MPDU1O75352 247 aa7.51□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 CST7O76096 145 aa7.51□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 CT45A10P0DMU9 189 aa7.51□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 SLAQ13239 276 aa7.51□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 ASAH1Q13510 395 aa7.51□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 S100ZQ8WXG8 99 aa7.51□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 C2orf50Q96LR7 162 aa7.51□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 SLC39A9Q9NUM3 307 aa7.51□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.5□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa7.5□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 FAM24AA6NFZ4 105 aa7.5□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 NMBP08949 121 aa7.5□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 SULT1A1P50225 295 aa7.5□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 S100A10P60903 97 aa7.5□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 IFITM3Q01628 133 aa7.5□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa7.5□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.5□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 MORN5Q5VZ52 161 aa7.5□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 MZT2BQ6NZ67 158 aa7.5□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.5□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 Q6ZSA8 131 aa7.5□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 ARPC5LQ9BPX5 153 aa7.5□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.5□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 TMEM14CQ9P0S9 112 aa7.5□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 TRBV19A0A075B6N1 114 aa7.49□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 RGS13O14921 159 aa7.49□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 GPX1P07203 203 aa7.49□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 FGF7P21781 194 aa7.49□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 VWC2Q2TAL6 325 aa7.49□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 Q6ZTI0 123 aa7.49□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 CHAC2Q8WUX2 184 aa7.49□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7.49□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.49□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.49□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 FUT9Q9Y231 359 aa7.49□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.49□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 TRAV5A0A0B4J249 113 aa7.48□□□□□ -1.21
RNF4-218ENST00000513284 KLLNB2CW77 178 aa7.48□□□□□ -1.21
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