RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477529.1

SRRT-210, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-210ENST00000477529 SERF2P84101 59 aa10.04□□□□□ -0.8
SRRT-210ENST00000477529 LYPD1Q8N2G4 141 aa10.04□□□□□ -0.8
SRRT-210ENST00000477529 VGLL1Q99990 258 aa10.04□□□□□ -0.8
SRRT-210ENST00000477529 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa10.04□□□□□ -0.8
SRRT-210ENST00000477529 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa10.03□□□□□ -0.8
SRRT-210ENST00000477529 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa10.03□□□□□ -0.8
SRRT-210ENST00000477529 KLLNB2CW77 178 aa10.03□□□□□ -0.8
SRRT-210ENST00000477529 H7BYZ3 331 aa10.03□□□□□ -0.8
SRRT-210ENST00000477529 STAG3L2P0CL84 134 aa10.03□□□□□ -0.8
SRRT-210ENST00000477529 STAG3L3P0CL85 134 aa10.03□□□□□ -0.8
SRRT-210ENST00000477529 TAS2R60P59551 318 aa10.03□□□□□ -0.8
SRRT-210ENST00000477529 SSX7Q7RTT5 188 aa10.03□□□□□ -0.8
SRRT-210ENST00000477529 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
SRRT-210ENST00000477529 LINC01587Q99440 93 aa10.03□□□□□ -0.8
SRRT-210ENST00000477529 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa10.03□□□□□ -0.8
SRRT-210ENST00000477529 DNAH6Q9C0G6 4158 aa10.03□□□□□ -0.8
SRRT-210ENST00000477529 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa10.02□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa10.02□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 CRISP2P16562 243 aa10.02□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 ZNF345Q14585 488 aa10.02□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 PRR9Q5T870 116 aa10.02□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 OR11H4Q8NGC9 324 aa10.02□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 Q8TAT8 98 aa10.02□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 RAB24Q969Q5 203 aa10.02□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 C16orf74Q96GX8 76 aa10.02□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 LINC00477Q96M19 166 aa10.02□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 OTORQ9NRC9 128 aa10.02□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 CYTL1Q9NRR1 136 aa10.02□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa10.02□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 ZNF492Q9P255 531 aa10.02□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 C7orf71A4D174 169 aa10.01□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 IGLL5B9A064 214 aa10.01□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 MBP02144 154 aa10.01□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 HTN1P15515 57 aa10.01□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 CD300CQ08708 224 aa10.01□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 BTN1A1Q13410 526 aa10.01□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 TMEM78Q5T7P6 136 aa10.01□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa10.01□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 APLNQ9ULZ1 77 aa10.01□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 FRAS1Q86XX4 4008 aa10□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa10□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 RBAKDNA6NC62 111 aa10□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 LYRM9A8MSI8 78 aa10□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 HMSDA8MTL9 139 aa10□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 DIRC3C9JPN6 131 aa10□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 TAAR5O14804 337 aa10□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 LY6G6CO95867 125 aa10□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 CSN1S1P47710 185 aa10□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 TCTAP57738 103 aa10□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 KCNRGQ8N5I3 272 aa10□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 NMBP08949 121 aa9.99□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 GCHFRP30047 84 aa9.99□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 DAD1P61803 113 aa9.99□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 ZNF726P1Q15940 193 aa9.99□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 ZNF493Q6ZR52 646 aa9.99□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 SUN5Q8TC36 379 aa9.99□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 HYLS1Q96M11 299 aa9.99□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 PYGO2Q9BRQ0 406 aa9.99□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa9.98□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 PGPA6NDG6 321 aa9.98□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 GPX1P07203 203 aa9.98□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 ZNF138P52744 262 aa9.98□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 LGALS9CQ6DKI2 356 aa9.98□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 RXFP4Q8TDU9 374 aa9.98□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 ARPC5LQ9BPX5 153 aa9.98□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 RPH3ALQ9UNE2 315 aa9.98□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa9.97□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 CXorf1O96002 111 aa9.97□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 GNG5P63218 68 aa9.97□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 FAM74A1Q5RGS3 127 aa9.97□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 Q6ZQT7 251 aa9.97□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa9.97□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 CMTM2Q8TAZ6 248 aa9.97□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 TMED6Q8WW62 240 aa9.97□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 ST6GAL2Q96JF0 529 aa9.97□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
SRRT-210ENST00000477529 GGTLC3B5MD39 225 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-210ENST00000477529 HTN3P15516 51 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-210ENST00000477529 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-210ENST00000477529 Q6ZNX1 250 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-210ENST00000477529 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-210ENST00000477529 C11orf72Q8NBR9 251 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-210ENST00000477529 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SRRT-210ENST00000477529 TMEM167BQ9NRX6 74 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-210ENST00000477529 LENEPQ9Y5L5 61 aa9.96□□□□□ -0.82
SRRT-210ENST00000477529 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-210ENST00000477529 A0A0D9SG52 128 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-210ENST00000477529 BCL2L11O43521 198 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-210ENST00000477529 DEFB130BP0DP73 79 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-210ENST00000477529 DEFB130AP0DP74 79 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-210ENST00000477529 CCDC28AQ8IWP9 274 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-210ENST00000477529 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SRRT-210ENST00000477529 LINC00612Q8N6U2 182 aa9.95□□□□□ -0.82
SRRT-210ENST00000477529 C5orf17Q8NAS9 161 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.1 ms