RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 OR4X1Q8NH49 305 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 VSTM2AQ8TAG5 236 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 FRZBQ92765 325 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 GGTLC1Q9BX51 225 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM167BQ9NRX6 74 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 TNCP24821 2201 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 A0A087WW49 117 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1W2PRE2 83 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 PAGE4O60829 102 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 LINC00869P0C866 280 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 NPPCP23582 126 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 NPY1RP25929 384 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 MC5RP33032 325 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 LGALS7P47929 136 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 RAB9AP51151 201 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 SELENOTP62341 195 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 AKIRIN2Q53H80 203 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 PYY3Q5JQD4 70 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 ACTL10Q5JWF8 245 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 OR4A47Q6IF82 309 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF343Q6P1L6 599 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF383Q8NA42 475 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 SLC24A4Q8NFF2 622 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 RFESDQ8TAC1 157 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 C11orf45Q8TAV5 145 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 SMIM12Q96EX1 92 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 MGST2Q99735 147 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 RNF5Q99942 180 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 ENY2Q9NPA8 101 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 PXMP4Q9Y6I8 212 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1B0GV50 99 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1W2PN81 502 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 J3QR06 171 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 REG1AP05451 166 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 OR5G3P0C626 314 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 CT45A6P0DMU7 189 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 CT45A5P0DMU8 189 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 CT45A7P0DMV0 189 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 GCHFRP30047 84 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 CHRNA7P36544 502 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 TAS2R45P59539 299 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 TAS2R60P59551 318 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 PKIAP61925 76 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 PAFAH1B2P68402 229 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 Q0VG73 95 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 EDDM3AQ14507 147 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 ADIRFQ15847 76 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 LGALS9BQ3B8N2 356 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 RASL11AQ6T310 242 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 PDPNQ86YL7 162 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 STXBP6Q8NFX7 210 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 OR1P1Q8NH06 330 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 HIST1H2BLQ99880 126 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 OSTCQ9NRP0 149 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 APLNQ9ULZ1 77 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 FUT9Q9Y231 359 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 OR51B2Q9Y5P1 312 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 ISLRO14498 428 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 CA2P00918 260 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 MT-ND6P03923 174 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 CRYGCP07315 174 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 P0DMU3 169 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 FAM231AP0DMU4 169 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 FAM231CP0DMU5 169 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 ERHP84090 104 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 HLA-DRB5Q30154 266 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 C1orf134Q5TEV5 83 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 ETFRF1Q6IPR1 90 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 FAM231DQ6ZW35 169 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 TCF23Q7RTU1 214 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 SLC16A13Q7RTY0 426 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 POM121L12Q8N7R1 296 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 THAP8Q8NA92 274 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 OR10G8Q8NGN5 311 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 MYOZ3Q8TDC0 251 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 SFRP2Q96HF1 295 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 PFDN5Q99471 154 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 CHRDL1Q9BU40 450 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 GNB1LQ9BYB4 327 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 SLC25A22Q9H936 323 aa4.52□□□□□ -1.69
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