RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427778.1

LINC00963-204, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00963, Length 382 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-204ENST00000427778 OR2G3Q8NGZ4 309 aa6.29□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 FAM210BQ96KR6 192 aa6.29□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.29□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.29□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 OR51M1Q9H341 326 aa6.29□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.29□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.29□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 APLNQ9ULZ1 77 aa6.29□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.28□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.28□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.28□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 LYRM9A8MSI8 78 aa6.28□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 H7BYZ3 331 aa6.28□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 M0R3E3 92 aa6.28□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 NMBP08949 121 aa6.28□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 CT45A10P0DMU9 189 aa6.28□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 CRISP2P16562 243 aa6.28□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 M6PRP20645 277 aa6.28□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 LEPP41159 167 aa6.28□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 TAS2R45P59539 299 aa6.28□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.28□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.28□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.28□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 RNF141Q8WVD5 230 aa6.28□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 ZNF503Q96F45 646 aa6.28□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 LINC00477Q96M19 166 aa6.28□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.28□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 PAXXQ9BUH6 204 aa6.28□□□□□ -1.4
LINC00963-204ENST00000427778 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.27□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 RBAKDNA6NC62 111 aa6.27□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 RNF222A6NCQ9 220 aa6.27□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 KLLNB2CW77 178 aa6.27□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 IGLL5B9A064 214 aa6.27□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 G3V3Q6 166 aa6.27□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 OR7C2O60412 319 aa6.27□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 OR10J4P0C629 311 aa6.27□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 EMP1P54849 157 aa6.27□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 ICAM4Q14773 271 aa6.27□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 Q5BKY6 102 aa6.27□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.27□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.27□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.27□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 BLNKQ8WV28 456 aa6.27□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.27□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 C16orf74Q96GX8 76 aa6.27□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.27□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 AZU1P20160 251 aa6.26□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 SERF2P84101 59 aa6.26□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 KIR3DS1Q14943 382 aa6.26□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.26□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.26□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.26□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 LINC01587Q99440 93 aa6.26□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.26□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.26□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.26□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 C7orf71A4D174 169 aa6.25□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 MBP02144 154 aa6.25□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 PRM2P04554 102 aa6.25□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 RAB2AP61019 212 aa6.25□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 DAD1P61803 113 aa6.25□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.25□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.25□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.25□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 SUN5Q8TC36 379 aa6.25□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 TMED6Q8WW62 240 aa6.25□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.25□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 Q9H3A6 140 aa6.25□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.25□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 NACAE9PAV3 2078 aa6.25□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.24□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 A0A1W2PPV4 95 aa6.24□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.24□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 STAG3L2P0CL84 134 aa6.24□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 STAG3L3P0CL85 134 aa6.24□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 ATP6V0CP27449 155 aa6.24□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 CSN1S1P47710 185 aa6.24□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 ZNF138P52744 262 aa6.24□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 RANP62826 216 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 ERCC8Q13216 396 aa6.24□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.24□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.24□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.24□□□□□ -1.41
LINC00963-204ENST00000427778 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms