RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 LRRC20Q8TCA0 184 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 FXYD5Q96DB9 178 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 ODF3Q96PU9 254 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 SMIM3Q9BZL3 60 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 ATP5G1P05496 136 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 ATP5G3P48201 142 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 BAP18Q8IXM2 172 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 OR2G3Q8NGZ4 309 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 TNFSF18Q9UNG2 199 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 PRELID1Q9Y255 219 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 NBEAP1P0C6P0 100 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 ZNF266Q14584 549 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 SCGB1C1Q8TD33 95 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 OR51M1Q9H341 326 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa8.65□□□□□ -1.02
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PRAME-204ENST00000403441 M0R3E3 92 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 PRM2P04554 102 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 M6PRP20645 277 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 CDKN1BP46527 198 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 RHOBP62745 196 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 OR2T35Q8NGX2 323 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 C16orf74Q96GX8 76 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 LINC01587Q99440 93 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 C20orf144Q9BQM9 153 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 HSPG2P98160 4391 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 CT45A10P0DMU9 189 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 TAS2R60P59551 318 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 TTC32Q5I0X7 151 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 RNF141Q8WVD5 230 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 PHYHIPLQ96FC7 376 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 PAXXQ9BUH6 204 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 OR10J4P0C629 311 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 HTN1P15515 57 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 AZU1P20160 251 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 ATP6V0CP27449 155 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 SERF2P84101 59 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 KHDC3LQ587J8 217 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 SSX7Q7RTT5 188 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 OR10J6PQ8NGY7 276 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 KLLNB2CW77 178 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 CRISP2P16562 243 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 TAS2R45P59539 299 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 RAB2AP61019 212 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 ICAM4Q14773 271 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 KIR3DS1Q14943 382 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 ZNF493Q6ZR52 646 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 SPATA12Q7Z6I5 190 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 Q8N1X5 172 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 SUN5Q8TC36 379 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 BLNKQ8WV28 456 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 LINC00477Q96M19 166 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 AAMDCQ9H7C9 122 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 OR7C2O60412 319 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 NMBP08949 121 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 STAG3L2P0CL84 134 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 STAG3L3P0CL85 134 aa8.6□□□□□ -1.03
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PRAME-204ENST00000403441 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 Q9H8V8 135 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 RBAKDNA6NC62 111 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 H7BYZ3 331 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 OR5I1Q13606 314 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 ZNF345Q14585 488 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 OR10G4Q8NGN3 311 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 OR10G9Q8NGN4 311 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 OR10G7Q8NGN6 311 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 Q9H3A6 140 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 SCRT2Q9NQ03 307 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-204ENST00000403441 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.59□□□□□ -1.03
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