RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370287.7

CSAG1-202, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAG1, Length 875 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-202ENST00000370287 TAS2R60P59551 318 aa10.63□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 PQLC2Q6ZP29 291 aa10.63□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa10.63□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 SSX7Q7RTT5 188 aa10.63□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 LINC00477Q96M19 166 aa10.63□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa10.63□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 APLNQ9ULZ1 77 aa10.63□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa10.62□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa10.62□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 H7BYZ3 331 aa10.62□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 STAG3L2P0CL84 134 aa10.62□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 STAG3L3P0CL85 134 aa10.62□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 ARL14EPLP0DKL9 152 aa10.62□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 BTN1A1Q13410 526 aa10.62□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 PRR9Q5T870 116 aa10.62□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 LYPD1Q8N2G4 141 aa10.62□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 OR11H4Q8NGC9 324 aa10.62□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 Q8TAT8 98 aa10.62□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 C20orf144Q9BQM9 153 aa10.62□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 CYTL1Q9NRR1 136 aa10.62□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 DNAH6Q9C0G6 4158 aa10.62□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa10.61□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa10.61□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa10.61□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 KLLNB2CW77 178 aa10.61□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 SERF2P84101 59 aa10.61□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 CD300CQ08708 224 aa10.61□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM78Q5T7P6 136 aa10.61□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa10.61□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 RAB24Q969Q5 203 aa10.61□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 C7orf71A4D174 169 aa10.6□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 PGPA6NDG6 321 aa10.6□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 CRISP2P16562 243 aa10.6□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 CSN1S1P47710 185 aa10.6□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 DAD1P61803 113 aa10.6□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 Q6ZQT7 251 aa10.6□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 C16orf74Q96GX8 76 aa10.6□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 HYLS1Q96M11 299 aa10.6□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 OTORQ9NRC9 128 aa10.6□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF492Q9P255 531 aa10.6□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 RPH3ALQ9UNE2 315 aa10.6□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 LYRM9A8MSI8 78 aa10.59□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 DIRC3C9JPN6 131 aa10.59□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 MBP02144 154 aa10.59□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 HTN3P15516 51 aa10.59□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF726P1Q15940 193 aa10.59□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CSAG1-202ENST00000370287 RBAKDNA6NC62 111 aa10.58□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 TAAR5O14804 337 aa10.58□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 GCHFRP30047 84 aa10.58□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF138P52744 262 aa10.58□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 GNG5P63218 68 aa10.58□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 LGALS9CQ6DKI2 356 aa10.58□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 KCNRGQ8N5I3 272 aa10.58□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 SUN5Q8TC36 379 aa10.58□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 GPX1P07203 203 aa10.57□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 DEFB130BP0DP73 79 aa10.57□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 DEFB130AP0DP74 79 aa10.57□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 TCTAP57738 103 aa10.57□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF345Q14585 488 aa10.57□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF493Q6ZR52 646 aa10.57□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 RXFP4Q8TDU9 374 aa10.57□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 PYGO2Q9BRQ0 406 aa10.57□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 HMSDA8MTL9 139 aa10.56□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 NMBP08949 121 aa10.56□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa10.56□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 CMTM2Q8TAZ6 248 aa10.56□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 ST6GAL2Q96JF0 529 aa10.56□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 ARPC5LQ9BPX5 153 aa10.56□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa10.55□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa10.55□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 CXorf1O96002 111 aa10.55□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 FAM74A1Q5RGS3 127 aa10.55□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa10.55□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 CCDC28AQ8IWP9 274 aa10.55□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa10.55□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 DNAH10Q8IVF4 4471 aa10.54□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa10.54□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 GGTLC3B5MD39 225 aa10.54□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 Q6ZNX1 250 aa10.54□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 IQCF2Q8IXL9 164 aa10.54□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 C11orf72Q8NBR9 251 aa10.54□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 LINC00467Q9BRT7 94 aa10.54□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 NDUFAF3Q9BU61 184 aa10.54□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM167BQ9NRX6 74 aa10.54□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa10.54□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 BCL2L11O43521 198 aa10.53□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa10.53□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM88Q6PEY1 159 aa10.53□□□□□ -0.72
CSAG1-202ENST00000370287 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.5 ms