RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 HTN1P15515 57 aa10.63□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 TAS2R60P59551 318 aa10.63□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 PQLC2Q6ZP29 291 aa10.63□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa10.63□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 SSX7Q7RTT5 188 aa10.63□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 LINC00477Q96M19 166 aa10.63□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa10.63□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 APLNQ9ULZ1 77 aa10.63□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa10.62□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa10.62□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 H7BYZ3 331 aa10.62□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 STAG3L2P0CL84 134 aa10.62□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 STAG3L3P0CL85 134 aa10.62□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 ARL14EPLP0DKL9 152 aa10.62□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 BTN1A1Q13410 526 aa10.62□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 PRR9Q5T870 116 aa10.62□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 LYPD1Q8N2G4 141 aa10.62□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 OR11H4Q8NGC9 324 aa10.62□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 Q8TAT8 98 aa10.62□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 C20orf144Q9BQM9 153 aa10.62□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 CYTL1Q9NRR1 136 aa10.62□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 DNAH6Q9C0G6 4158 aa10.62□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa10.61□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa10.61□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa10.61□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 KLLNB2CW77 178 aa10.61□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 SERF2P84101 59 aa10.61□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 CD300CQ08708 224 aa10.61□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM78Q5T7P6 136 aa10.61□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa10.61□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 RAB24Q969Q5 203 aa10.61□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 C7orf71A4D174 169 aa10.6□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 PGPA6NDG6 321 aa10.6□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 CRISP2P16562 243 aa10.6□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 CSN1S1P47710 185 aa10.6□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 DAD1P61803 113 aa10.6□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 Q6ZQT7 251 aa10.6□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 C16orf74Q96GX8 76 aa10.6□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 HYLS1Q96M11 299 aa10.6□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 OTORQ9NRC9 128 aa10.6□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF492Q9P255 531 aa10.6□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 RPH3ALQ9UNE2 315 aa10.6□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 LYRM9A8MSI8 78 aa10.59□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 DIRC3C9JPN6 131 aa10.59□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 MBP02144 154 aa10.59□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 HTN3P15516 51 aa10.59□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF726P1Q15940 193 aa10.59□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 RBAKDNA6NC62 111 aa10.58□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 TAAR5O14804 337 aa10.58□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 GCHFRP30047 84 aa10.58□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF138P52744 262 aa10.58□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 GNG5P63218 68 aa10.58□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 LGALS9CQ6DKI2 356 aa10.58□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 KCNRGQ8N5I3 272 aa10.58□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 SUN5Q8TC36 379 aa10.58□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 GPX1P07203 203 aa10.57□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 DEFB130BP0DP73 79 aa10.57□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 DEFB130AP0DP74 79 aa10.57□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 TCTAP57738 103 aa10.57□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF345Q14585 488 aa10.57□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF493Q6ZR52 646 aa10.57□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 RXFP4Q8TDU9 374 aa10.57□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 PYGO2Q9BRQ0 406 aa10.57□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 HMSDA8MTL9 139 aa10.56□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 NMBP08949 121 aa10.56□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa10.56□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 CMTM2Q8TAZ6 248 aa10.56□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 ST6GAL2Q96JF0 529 aa10.56□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 ARPC5LQ9BPX5 153 aa10.56□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa10.55□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa10.55□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 CXorf1O96002 111 aa10.55□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 FAM74A1Q5RGS3 127 aa10.55□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa10.55□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC28AQ8IWP9 274 aa10.55□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa10.55□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 DNAH10Q8IVF4 4471 aa10.54□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa10.54□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 GGTLC3B5MD39 225 aa10.54□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 Q6ZNX1 250 aa10.54□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 IQCF2Q8IXL9 164 aa10.54□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 C11orf72Q8NBR9 251 aa10.54□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 LINC00467Q9BRT7 94 aa10.54□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 NDUFAF3Q9BU61 184 aa10.54□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM167BQ9NRX6 74 aa10.54□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa10.54□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 BCL2L11O43521 198 aa10.53□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa10.53□□□□□ -0.72
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM88Q6PEY1 159 aa10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1139.8 ms