RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa3.37□□□□□ -1.87
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PTPRC-201ENST00000348564 GAGE12JA6NER3 117 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 H7C1H1 209 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 BCL2L11O43521 198 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF138P52744 262 aa3.37□□□□□ -1.87
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PTPRC-201ENST00000348564 SMAGPQ0VAQ4 97 aa3.37□□□□□ -1.87
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PTPRC-201ENST00000348564 FAM90A2PQ658T7 463 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRC-201ENST00000348564 H3BMM0 161 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 I3L521 148 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRC-201ENST00000348564 MALP21145 153 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRC-201ENST00000348564 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 GNG5P63218 68 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 RHEBQ15382 184 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM256Q8N2U0 113 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC140Q96MF4 163 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 U3KQE9 123 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa3.35□□□□□ -1.87
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