RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295522.3

CLDN1-201, Transcript of claudin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN1, Length 3,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN1-201ENST00000295522 CGB1A6NKQ9 187 aa8.05□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 FHL3Q13643 280 aa8.05□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 RITA1Q96K30 269 aa8.05□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 IGLV2-11P01706 119 aa8.05□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 RPL7P18124 248 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 EMP1P54849 157 aa8.05□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 POU2AF1Q16633 256 aa8.05□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 A8MWV9 139 aa8.04□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 J3KRW8 73 aa8.04□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 SPRR3Q9UBC9 169 aa8.04□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 RAXQ9Y2V3 346 aa8.04□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 SPTA1P02549 2419 aa8.04□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 ZNF815PA8K554 130 aa8.04□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 FSTL3O95633 263 aa8.04□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 CNTFRP26992 372 aa8.04□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 Q1RN00 199 aa8.04□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.04□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 CUL9Q8IWT3 2517 aa8.04□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 CEP192Q8TEP8 1941 aa8.04□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 TSPAN13O95857 204 aa8.04□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 RNF7Q9UBF6 113 aa8.04□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 PROCRQ9UNN8 238 aa8.04□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 CCDC179H3BU77 68 aa8.03□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 ATP5LO75964 103 aa8.03□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 PMS2CLQ68D20 193 aa8.03□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 THAP8Q8NA92 274 aa8.03□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 PRO0461Q9UI25 63 aa8.03□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 A6NJY4 79 aa8.02□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 CD40P25942 277 aa8.02□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 RAX2Q96IS3 184 aa8.02□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 TRGV9Q99603 122 aa8.02□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 FBXL15Q9H469 300 aa8.02□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 ONECUT1Q9UBC0 465 aa8.02□□□□□ -1.12
CLDN1-201ENST00000295522 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.02□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 GAGE12JA6NER3 117 aa8.02□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 GAGE7O76087 117 aa8.02□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 IGHV3-23P01764 117 aa8.02□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 GAGE12FP0CL80 117 aa8.02□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 GAGE12GP0CL81 117 aa8.02□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 GAGE12IP0CL82 117 aa8.02□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 GAGE4Q13068 117 aa8.02□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa8.02□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 ZNF785A8K8V0 405 aa8.02□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 MSMPQ1L6U9 139 aa8.02□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 Q6ZT83 130 aa8.02□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa8.02□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa8.01□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 ZNF688P0C7X2 276 aa8.01□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.01□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.01□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.01□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 LOC400499M0QZD8 3231 aa8.01□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 C9JAW5 83 aa8.01□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa8.01□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.01□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.01□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 CCL11P51671 97 aa8.01□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 TEN1Q86WV5 123 aa8.01□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa8.01□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 CCL17Q92583 94 aa8.01□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 SPRY2O43597 315 aa8□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 HLA-DMBP28068 263 aa8□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa8□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 TMEM155Q4W5P6 130 aa8□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 LYRM7Q5U5X0 104 aa8□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 ZNF493Q6ZR52 646 aa8□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 KALRNO60229 2985 aa8□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 SLC25A16P16260 332 aa7.99□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 COX7A1P24310 79 aa7.99□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa7.99□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 GAFA1Q96PS6 74 aa7.99□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa7.99□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 IGKV3-15P01624 115 aa7.99□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.99□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.99□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 RNF125Q96EQ8 232 aa7.99□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 CARD19Q96LW7 228 aa7.99□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 TACC2O95359 2948 aa7.99□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.99□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 TCL1BO95988 128 aa7.99□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 IGHV4-39P01824 125 aa7.99□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 CGB3P0DN86 165 aa7.99□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 CGB7P0DN87 165 aa7.99□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 LAGE3Q14657 143 aa7.99□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.99□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 ERCC8Q13216 396 aa7.98□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 DTX2Q86UW9 622 aa7.98□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 CTSZQ9UBR2 303 aa7.98□□□□□ -1.13
CLDN1-201ENST00000295522 ABCA4P78363 2273 aa7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.7 ms