RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440		B5MCH6	92 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	SHBG	P04278	402 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	FABP3	P05413	133 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	PGAM2	P15259	253 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	MT4	P47944	62 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	3.18	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB2A	P61019	212 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	UBE2D3	P61077	147 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	CFAP161	Q6P656	301 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	TNFAIP8	O95379	198 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	OSM	P13725	252 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	CXCL3	P19876	107 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	LYZ	P61626	148 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	CATR1	Q13166	79 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	MPV17L2	Q567V2	206 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	EPGN	Q6UW88	154 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	C15orf56	Q8N910	161 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	SPX	Q9BT56	116 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	SSR3	Q9UNL2	185 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	C5orf51	A6NDU8	294 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	HLA-DQB1	P01920	261 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC00694	P0DN24	101 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	GZMB	P10144	247 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	RAP2B	P61225	183 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	VSNL1	P62760	191 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	SPC24	Q8NBT2	197 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNS1	Q96KK3	526 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	ODF3	Q96PU9	254 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	TSC22D3	Q99576	134 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM168B	A1KXE4	195 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	IGKV1-39	P01597	117 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	IGKV1D-39	P04432	117 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	CDK1	P06493	297 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	GABRB1	P18505	474 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP6V1E1	P36543	226 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440		Q499Y3	187 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	KRAS	P01116	189 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	NPPA	P01160	153 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC25A4	P12235	298 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	UBE2B	P63146	152 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB11B	Q15907	218 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	GID4	Q8IVV7	300 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	ORAI1	Q96D31	301 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	CARD19	Q96LW7	228 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR82	Q96P67	336 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	CKLF	Q9UBR5	152 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	C20orf202	A1L168	122 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	DIRC3	C9JPN6	131 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440		J3QLW9	94 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	MRAS	O14807	208 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC16A6	O15403	523 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	PRKY	O43930	277 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	CIDEA	O60543	219 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	RAP2A	P10114	183 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF19	P17023	458 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	G6PC	P35575	357 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	INPP1	P49441	399 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		3.13	□□□□□ -1.91

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